刚果民主共和国本土豚鼠基因组特征与种群结构解析：育种与保护策略新视角

针对非洲刚果民主共和国(DRC)豚鼠种群遗传多样性不清的问题，研究人员采用13个SSR标记对343只样本进行基因组分析，发现种群存在3个基因库，南基伍省群体遗传多样性最高(等位基因7.23个/位点)，近交系数(FIS=0.42)显示严重近交。研究为制定区域性育种策略提供分子依据，对改善小型家畜生产系统具有重要意义。

　　

在非洲撒哈拉以南地区，豚鼠(Cavia porcellus)作为重要的"微型家畜"，为小农户提供优质蛋白质来源和有机肥料。然而，刚果民主共和国(DRC)的豚鼠生产长期面临遗传背景不清、近交退化等问题，制约着这一传统养殖业的可持续发展。更令人担忧的是，当地养殖户普遍采用地面散养模式，缺乏科学的育种管理，导致种群遗传多样性持续流失。这些"厨房地板上的牲畜"究竟隐藏着怎样的基因密码？如何通过科学手段解开其遗传奥秘，为资源保护和品种改良提供依据？

来自刚果民主共和国福音大学(Université Evangélique en Afrique)的研究团队开展了一项开创性研究，他们首次对DRC四个主要产区（南基伍、北基伍、加丹加和金沙萨）的343只豚鼠进行系统基因组分析。这项发表在《Veterinary and Animal Science》的研究，通过13个多态性微卫星标记(SSR)揭示了该国豚鼠种群的遗传特征，为制定区域性保护策略提供了关键科学依据。

研究采用多项关键技术：基于FTA卡的DNA提取技术实现野外样本稳定保存；16对荧光标记SSR引物进行PCR扩增（最终13个成功扩增）；利用GenAIEx 6.4和STRUCTURE软件分析遗传参数和种群结构；采用Nei遗传距离构建系统发育树；通过核心种质构建策略筛选代表性个体。特别值得注意的是，研究整合了喀麦隆和科特迪瓦的已有SSR数据，实现跨国比较。

研究结果呈现四大发现：

1. 遗传多样性特征：共检测到113个等位基因，平均每个位点5.77个等位基因。南基伍种群遗传多样性最高（7.23个等位基因/位点），金沙萨最低（4.69个）。观察杂合度(Ho=0.34)显著低于期望值(He=0.58)，反映严重近交(F_IS=0.42)。

2. 种群分化格局：分子方差分析(AMOVA)显示8%变异存在于种群间，92%来自种群内部。南基伍保有最多私有等位基因（22个），其近交系数(F_IS=0.35)显著低于加丹加地区(0.57)。

3. 系统发育关系：邻接树和STRUCTURE分析一致将343个个体划分为3个基因库。南基伍种群独立成簇，而北基伍与加丹加种群高度混合，反映区域性动物交换。

4. 核心种质构建：筛选41只个体（占总数12%）建立的"核心种质"保留全部等位基因，为后续育种计划提供优化样本集。

在讨论部分，Rodrigue Ayagirwe等学者指出三个关键点：首先，DRC豚鼠的遗传多样性水平低于南美原产地但高于其他非洲国家，印证"奠基者效应"假说。其次，南基伍较低的近交程度可能与澳大利亚国际开发署(AusAID)支持的改良项目有关，证明管理干预的有效性。最重要的是，研究提出的"三基因库"模型为制定差异化育种策略奠定基础——南基伍种群可作为遗传改良的核心资源，而北基伍与加丹加种群需重点防范近交衰退。

这项研究不仅填补了DRC小型家畜遗传资源的本底空白，更创新性地提出"区域性核心种质"保护策略。正如作者强调的，未来应建立国家级的豚鼠育种协会，将分子标记辅助选择(MAS)与传统育种相结合。值得关注的是，研究中发现的Cavy12位点（含41个等位基因）可能成为监测遗传多样性的"超级标记"，为发展中国家低成本开展遗传评估提供技术选择。该成果为非洲混合农业系统中"被忽视的家畜"资源保护树立了典范，其方法论也可推广至其他发展中国家的小型经济动物研究。