条件性通用微分方程揭示C肽分泌的群体动态与个体差异:从β细胞功能衰退到精准医疗新范式

【字体: 时间:2025年08月01日 来源:npj Systems Biology and Applications 3.5

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  本研究针对生物医学数据中普遍存在的个体异质性难题,创新性地提出条件性通用微分方程(cUDE)框架,成功整合生理驱动模型与机器学习优势,解决了传统通用微分方程(UDES)在糖尿病进展研究中难以捕捉β细胞功能个体差异的瓶颈问题。通过建立C肽分泌动力学模型,研究人员不仅实现了对正常糖耐量(NGT)、糖耐量受损(IGT)和2型糖尿病(T2DM)群体的精准预测,更发现条件参数与金标准高糖钳夹技术测量的胰岛素分泌量高度相关(-0.805),为糖尿病精准分型和治疗选择提供了新的量化指标。

  

在糖尿病研究领域,一个长期存在的关键难题是如何量化β细胞功能的个体差异——这种差异不仅是疾病进展的标志物,更直接影响治疗响应。传统生理数学模型(PBMM)虽具解释性但建模耗时,而纯数据驱动的机器学习方法又面临小样本临床数据下的过拟合风险。更棘手的是,现有方法难以同时实现模型普适性与个体化预测,特别是在描述从正常糖耐量(NGT)到糖尿病(T2DM)连续演变过程中β细胞功能的渐进性衰退。

荷兰埃因霍温理工大学(Eindhoven University of Technology)的研究团队开创性地提出条件性通用微分方程(cUDE)框架。该模型在van Cauter两室C肽动力学模型基础上,创新性地引入带有个体化条件参数βi的神经网络,成功捕捉葡萄糖刺激下C肽分泌的群体规律与个体差异。研究采用包含117人(NGT/IGT/T2DM)的Ohashi队列数据,通过分层训练-验证-测试集设计,证明cUDE显著优于传统UDE(测试集MSE降低42%)。令人振奋的是,条件参数βi与高糖钳夹测量的第一阶段胰岛素分泌量呈现-0.805的强相关,成为β细胞功能的数字化生物标志物。

关键技术包括:1)构建两室C肽动力学ODE模型,个体化计算k0-k2参数;2)设计双输入(葡萄糖增量ΔGpl+个体参数βi)神经网络架构;3)采用符号回归从训练网络推导出Michaelis-Menten型解析式P(t)=1.78·ΔGpl/(kM+ΔGpl);4)通过独立队列(Fujita数据集)验证模型外推能力。

模型性能验证
在测试集中,cUDE对NGT、IGT和T2DM个体的C肽曲线拟合优度(R2>0.92)显著优于传统方法。特别值得注意的是,模型仅需29例训练样本即可稳定收敛,展现优异的数据效率。

生理相关性发现
条件参数βi不仅区分疾病状态(NGT:0.82±0.21 vs T2DM:2.15±0.43),更与年龄(r=0.61)、胰岛素敏感指数(r=-0.32)构成特征网络,提示其可反映β细胞功能的自然衰退与病理损伤双重过程。

模型普适性突破
解析式模型在未见过的Fujita数据集中,成功预测240分钟OGTT曲线(平均误差<8%),突破原训练120分钟的时间限制,证实学习机制的生物学合理性。

这项研究开创了微分方程与机器学习融合的新范式:cUDE框架通过共享网络权重、个体化条件参数的设计,既保持模型可解释性,又实现个体化预测。所得C肽分泌方程与经典Topp模型的高度相似性,从数据科学角度验证了β细胞葡萄糖传感的Michaelis-Menten动力学本质。更重要的是,该研究为糖尿病精准医疗提供了可量化的新工具——条件参数βi可作为临床试验分层指标或动态监测β细胞功能衰退的无创替代终点。未来,该框架可扩展至其他内分泌轴研究,或整合GLP-1等肠促胰素信号,构建更全面的胰岛素分泌调控数字孪生模型。

研究也存在若干局限:队列仅含日本人群,且未考虑氨基酸刺激的C肽响应。但无论如何,这项工作为小样本生物医学数据建模树立了新标杆,其"机制约束下的数据驱动"理念,为系统生物学与人工智能的深度融合提供了典范案例。正如作者强调:"cUDE的核心价值在于将生理学知识编码为机器学习先验,使模型既能探索未知动力学,又不脱离生物合理性轨道"。

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