南半球信天翁基因组破译:反极地与吉布森亚种(Diomedea antipodensis)高质量参考基因组构建及其保护遗传学意义

【字体: 时间:2025年08月09日 来源:Journal of Heredity 2.5

编辑推荐:

  研究人员采用牛津纳米孔测序技术(ONT)结合Flye算法,成功构建了反极地信天翁(D. a. antipodensis)和吉布森信天翁(D. a. gibsoni)的高质量参考基因组,组装大小约1.25Gb,最大60个支架的BUSCO完整性达97%。该研究通过全基因组比对揭示了信天翁种群基因组结构,为濒危海鸟保护单元划分和适应性进化研究提供了关键基因组资源。

  

信天翁科(Diomedeidae)作为高度濒危的海鸟类群,正面临渔业兼捕导致的种群衰退危机。研究团队突破传统遗传标记限制,首次运用长读长纳米孔测序技术(Oxford Nanopore Technology)对南半球两个亚种——反极地信天翁(Diomedea antipodensis antipodensis)和吉布森信天翁(D. a. gibsoni)进行全基因组测序,采用Flye算法分别获得包含255和313个支架的基因组组装。虽然未达到染色体水平,但通过与科里氏鹱(Calonectris borealis)染色体级别基因组的比对显示,多数染色体可能仅由少量大支架代表。两个基因组中前60个最大支架的保守单拷贝基因(BUSCO)评估值均接近97%,证实了组装的高完整性。这些突破性成果为解析信天翁种群基因组多样性、基因流模式及适应性变异提供了关键分子工具,将显著提升对这类"海洋流浪者"分类学争议的认知,指导气候变化背景下的科学保护策略制定。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号