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南半球信天翁基因组破译:反极地与吉布森亚种(Diomedea antipodensis)高质量参考基因组构建及其保护遗传学意义
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月09日 来源:Journal of Heredity 2.5
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研究人员采用牛津纳米孔测序技术(ONT)结合Flye算法,成功构建了反极地信天翁(D. a. antipodensis)和吉布森信天翁(D. a. gibsoni)的高质量参考基因组,组装大小约1.25Gb,最大60个支架的BUSCO完整性达97%。该研究通过全基因组比对揭示了信天翁种群基因组结构,为濒危海鸟保护单元划分和适应性进化研究提供了关键基因组资源。
信天翁科(Diomedeidae)作为高度濒危的海鸟类群,正面临渔业兼捕导致的种群衰退危机。研究团队突破传统遗传标记限制,首次运用长读长纳米孔测序技术(Oxford Nanopore Technology)对南半球两个亚种——反极地信天翁(Diomedea antipodensis antipodensis)和吉布森信天翁(D. a. gibsoni)进行全基因组测序,采用Flye算法分别获得包含255和313个支架的基因组组装。虽然未达到染色体水平,但通过与科里氏鹱(Calonectris borealis)染色体级别基因组的比对显示,多数染色体可能仅由少量大支架代表。两个基因组中前60个最大支架的保守单拷贝基因(BUSCO)评估值均接近97%,证实了组装的高完整性。这些突破性成果为解析信天翁种群基因组多样性、基因流模式及适应性变异提供了关键分子工具,将显著提升对这类"海洋流浪者"分类学争议的认知,指导气候变化背景下的科学保护策略制定。
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