
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
遗传与环境因素驱动黏细菌Myxococcus xanthus群体迁移与聚集的分子机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月22日 来源:Scientific Reports 3.9
编辑推荐:
本研究针对黏细菌Myxococcus xanthus发育过程中"交通堵塞模型"(TJM)的核心假设展开验证,通过定量定义"细胞流"(streams)并开发新型流检测算法,首次证实细胞流并非聚集起始的必要条件,但可加速该过程。研究人员结合荧光细胞追踪与时间序列成像技术,发现A-运动系统缺失突变体(A-S+)可不依赖细胞流形成聚集体,而S-运动系统缺陷株(A+S-)虽能形成细胞流却无法稳定聚集,揭示了运动系统对群体行为的差异化调控。该成果发表于《Scientific Reports》,为微生物群体行为研究提供了新的理论框架。
在微生物世界的集体行为研究中,黏细菌Myxococcus xanthus始终是科学家关注的焦点。当面临饥饿压力时,数百万个M. xanthus细胞会展现出令人惊叹的自组织能力——它们从分散状态逐渐聚集成规则的子实体结构。这一过程被广泛接受的"交通堵塞模型"(Traffic Jam Model, TJM)认为:细胞首先通过平行排列形成"细胞流"(streams),流间交叉导致细胞拥挤停滞,进而触发聚集。然而这个看似完美的理论存在致命缺陷:既缺乏对"细胞流"的量化定义,也从未验证过流交叉与聚集的因果关系。
为解开这个科学谜团,Syracuse大学和Rice大学的联合研究团队开展了一项系统性研究。研究人员首先建立了细胞流的四大定量标准:细胞运动性、局部排列度、区域密度和时空持续性,并创新性地开发出"流检测掩膜"(stream detection mask)技术。通过对比野生型(WT)与两种运动缺陷突变体(A-S+和A+S-)在高低细胞密度下的行为差异,研究获得了颠覆性发现:细胞流既非聚集起始的必要条件,其空间分布也与聚集体位置无显著相关性。
关键技术方法包括:1) 构建tdTomato荧光标记菌株进行单细胞追踪;2) 开发基于光学流(optical flow)和傅里叶变换的流检测算法;3) 采用时间序列显微成像记录发育动态;4) 建立定量分析模型计算位移、排列度等参数。实验使用DK1622野生型及DK1218(cglB2-)、DK1253(tgl1-)突变体,通过TPM饥饿培养基诱导发育。
主要研究结果
细胞流的定量定义与检测
通过分析1帧/分钟的时间序列图像,研究人员首次将细胞流定义为同时满足四大特征的区域:运动速度>0.1μm/s、局部排列度>0.5、细胞密度在特定阈值区间、持续存在时间>15分钟。流检测掩膜成功区分了"前流相"(pre-stream phase)的随机运动与"流相"(stream phase)的高度组织化运动,其中WT菌株在低密度(LD)条件下流覆盖率最高达40%。
细胞流与聚集的时空关系
野生型在LD和HD(高密度)条件下均显示流形成先于聚集启动(LD:流峰值早于聚集160分钟;HD:早于20分钟)。但统计分析表明,聚集体周围区域的流分布比例(P(stream|band)=0.38)与外围区域(P(stream|outside)=0.41)无显著差异(p>0.05),且约80%的HD聚集体形成机制与流交叉无关。
运动系统的遗传调控
A-S+突变体(缺失A-运动)可完全不依赖细胞流形成聚集体,但耗时比WT延长13小时;而A+S-突变体(缺失S-运动)虽能形成细胞流却无法完成稳定聚集。细胞追踪显示A+S-的位移(45μm)显著高于A-S+(25μm),证实两种运动系统对群体行为的差异化调控。
讨论与意义
这项研究从根本上动摇了流行数十年的TJM理论框架:1) 通过建立细胞流的首个定量标准,解决了该领域长期存在的定义混乱问题;2) 证实聚集起始存在多机制并行通路,仅约20%案例符合流交叉引发聚集的假设;3) 揭示A-运动系统是流形成的必要条件,而S-运动系统对维持聚集稳定性至关重要。
研究提出的"流加速模型"(Stream-Acceleration Model)更符合实验证据:细胞流虽非必需,但能通过提高细胞位移效率(WT:63μm vs A-S+:29μm)加速聚集进程。这一发现为理解微生物群体智能(self-organization)提供了新视角,其开发的流检测算法也可拓展至其他群体行为研究领域。未来研究需进一步探索:1) 除机械相互作用外,化学信号在聚集定位中的作用;2) EPS(胞外多糖)与C-信号系统对聚集稳定性的调控机制。

https://hunyuan-plugin-1258344706.cos.ap-nanjing.myqcloud.com/pdf_youtu/img/29cb5c8cd00a158cabd178b66fb20f28-image.png' caption=''>https://hunyuan-plugin-1258344706.cos.ap-nanjing.myqcloud.com/pdf_youtu/img/29cb5c8cd00a158cabd178b66fb20f28-image.png' caption='fig.2. stream mask generation to detect stream location in m. xanthus.(a) visual representation of pre-stream and stream phase in ld time-lapse movies. a 400 by 400-pixel region of the original images are shown here.(b) stream features used to generate stream masks. the stream phase compared with pre-stream phase indicates a greater number of cells with higher velocity(green velocity vector arrows), improved cell alignment(green alignment vector lines) along long axis of stream pathway, higher local density(pixel intensity) in streams compared to surroundings, and stream persistence for 5 min in the stream phase. the red boxes provide close-up view of cell velocity and alignment during the two phases compared. time persistence images are derived from 1:20 dilution images, recorded in the tdtomato channel, by combining pixel intensities of five frames. time persistence images are used to calculate velocity using optical flow method, alignment by fourier transformation, and density using gaussian filter.(c) a breakdown of the individual masks used to generate the stream mask. to generate individual masks, thresholds are applied to remove regions of low speed,low alignment, and lower- and higher-density regions. black represents regions removed by the threshold.white represents regions meeting the required threshold. stream masks capture regions where the thresholds for all four features, including time persistence, are met. during the stream phase a higher percentage of the field of view has attained threshold speed, local alignment, local density, and stream persistence, and therefore a higher percentage of streams. 30-min stream persistence is shown in the first column; to be qualified as a stream, the stream mask must detect its presence for at least 15 min. white represents streams and black indicates absence of streams.(d-g) quantitative representation of the changes captured by individual masks over time. the data shown is an average, maximum and minimum of 50 samples from four replicate experiments.(h) visual detection of stream formation over time using the stream mask. the highest stream detection is between 90 to 119 min
生物通微信公众号
知名企业招聘