最大的小鼠与人基因组比较揭示父母之争

　　

通常人体不能区分继承自母亲和父亲的基因，但是一些基因被特异地被标示从而父母之一的那个拷贝关闭另一人的拷贝。这些基因只是维持父母的一些记忆的基因。

当对一个有多名发育障碍的成员的家族进行研究时，密歇根大学的Andy Feinberg和同事们，几乎是偶然地发现了一个被标示基因的密集区。他们将定位在11号染色体上的疾病基因进一步精确地定位到那些从父母继承来的部分。

现在在约翰霍普金斯大学医学院的Feinberg决定对人类的该区域与小鼠定位于7号染色体上的同源区域进行比较。Feinberg补充道，被标示基因倾向于聚集成区，在其它染色体上至少发现了两个其它的被标示基因。研究的结果发表在11月14日出版的《Genome Research》上。

杜克大学医学中心的放射生物学家Randy Jirtle说，由于可能存在有高达1000个这种被标示基因，到目前为止研究者可能只发现了这些标示基因中大约50个。

这些被标示基因中有很多在出生前发育中非常重要，比如来自父亲的强调大程度增长的拷贝，和来自母亲的限制出生前增长的拷贝，Jirtle说，也许这显示了儿童与母亲在争夺营养上的进化战。当这些基因没有被正确标示时，它们经常导致肿瘤的生长。

据该报道，Freinberg在相邻的100万个碱基长度内进行的研究是“迄今为止，对一个定向的有序的单一结构域进行的最大的序列比较分析。”因为该区域含有高密度的被标示基因，两边是编码非被标示基因的区域，所以Feinberg将他的研究限制在该特定长度范围内。

Feinberg说，研究的结果提供了任何基因组全部被标示基因的第一个全面的见解。他说：“我不认为我高估了事实，”补充说，该研究提供了“一个对比较基因组学的有力支持……，它开始告诉我们什么是重要的区域。”

加上小鼠与人类基因组之间82个类似的，或者说保守的非基因DNA序列，这个实验揭示了该区域中的所有基因。Feinberg说：“如果有理由在进化中保存这些基因，那么很可能这些基因将是重要的。”

Feinberg惊奇地发现两种动物之间只有82个非基因序列是保守的。他指出那只是非基因序列中的4%。

Feinberg强调说，虽然这些非基因片断可能对于调节或控制标示是重要的，但是还没有人知道它们对标示作用到底有多重要。他说：“我们已经研究了序列中的不同，接下来将是进行遗传和生化分析，以努力决定这些区域的功能。”

Randy Jirtle希望了解这些非编码区域在进化中可以追溯到多远以前。他已经在有袋动物中发现了这种基因标示，但是在鸟类中没有找到，他说比较其它物种中的标示区域将是重要的。他说：“那将去除数据中的许多‘信噪’。”

斯坦福大学的Andrew Hoffman对文章的原稿进行了评改，并且在同一期《Genome Research》上撰写了一篇评论。在电话采访中他说：“Feinberg实验室的工作是一个真正的绝技，代表了相当大量的工作……其中有很多值得进行更仔细的研究，但是这还只是第一步。重要的是该工作为我们指出了正确的方向。”

——摘译自11月14日news.bmn.com