测序机器人如何实现自动化？Whitehead中心泄漏秘诀

　　

    [生物通讯]人类大张旗鼓对自己的基因组测序，但使这一切成为可能的却是机器人。

    而肩负加快机器人测序速度重任的人就是Andrew Sheridan－－美国Whitehead基因组研究中心自动化控制协调员。

    时间表变了，因为人类基因组计划要求我们的设备在1年内速度加快10倍。”Sheridan在周二举行的实验室自动化会议上发言时解释说。他补充说，他的研究小组大约花了8个月的时间实现了目标，而12个月时，机器人的测序速度已提升至20倍。

   “这对一个研究实验室而言是相当不错的速度。”他认为。

    但我们是如何做到这一切的？Sheridan主张其它实验室可以分别购买一个操作系统的各组件。

   “我们尽力购买工具，而不是工具包。”Sheridan说道。“如果你不能拆卸这个系统，根据需要做一些更改，你就不会有大的进展。”

     Whitehead中心测序使用的机器人系统包括7个菌落检出器，约150个检测组件，2个分别用于接种和重悬浮的组件,以及3个DAN样品初级制备和次级制备组件。

        Sheridan还通过独立匹配各组件使循环时间最小化。“如果购进的仪器不能始终使用，那么你没有将阻抗匹配好。”Sheridan认为，他建议简化流程步骤，使各组件输出相互匹配以减少循环时间。

    他还建议取消分批加工和支架设备，这样有利于回馈系统连续运行。

   “存储栈数据是退出舞台的时候了。”他强调说。

    Sheridan还推荐将机器人与网络分开，以避免由于数据库或网络故障而引起工作停顿。“我们痛恨因网络引起的系统运转停止。”他解释说。

    最优化机器人系统的第一号秘诀是什么？人。

   “最重要的一点就是人的类型。”Sheridan说。“每个人都吃惊于我们的队伍，各种背景的专业人员在为着同一个目标而努力。”

    要得到最好的结果，最好将生物学家、计算机科学家和其它专业人员尽可能紧密地团结起来，他说。“人力资源的合作拉近了彼此的距离。”他强调。

生物通摘译自GENOMEWEB