改写生命树

　　

生物通报道：一个多世纪以来，“生命树”已经成为描述人类、植物群落、动物群落和微生物世界的进化关系的一个最常用的比喻。但是，二十世纪九十年代中期，微生物新基因的信息使得生命树的最低分枝陷入混乱状态。现在，一些生物学家提出了构建生命树的新方法：细菌、古细菌和真核细胞微生物间发生的广泛的交换意味着最低分枝应该画成具有不同生物群体的“环”。相关文章发表在9月9日的Nature上。

 在过去的20年里，分类学者不断地依靠基因序列的差异来确定物种的亲缘关系。因此，微生物学者现在将细菌叫做原核生物，并且将其划分为细菌和古细菌两组。但是，他们还不能确定哪个原核类群产生了更为复杂的真核细胞。

 为了理清这些关系，加州大学的Maria Rivera和James Lake设计了一个复杂的计算机程序，用于检测两个酵母种类和25种细菌和古细菌的基因组。他们尤其感兴趣的是一个生物基因组因为另一个生物的基因迁入而变得混乱的发生时间。他们还试图寻找两个基因组融合时的实例。

 研究结果表明真核细胞通过远古细菌和类似eocyta（喜生活在高温下）的古细菌融合形成了细胞核基因组。这个信息暗示出在早期生命历史中，许多微生物通过吞噬它们的邻居的DNA来积累基因。这种状况通过一个树型图是无法表示清楚的。生命树能够表示出由一个共同祖先衍生出的类群。因此，他们建议用一个“环”能够很好地表示出这些关系。依据这个观点，经常发生的基因和基因组混合使一些生物无法进化它们自己的基因组的个性。纽卡斯尔大学的T. Martin Embley说，这种环形图精确地表示出真核细胞的起源，但是他也指出“这项研究必定会引起争议。”Paris-Sud大学的Patrick Forterre觉得这些分析还比较无力，因为它不能合并足够的真核基因。