从新基因组测序结果中寻找新型药物

　　

生物通报道：由英国曼彻斯特大学（University of Manchester）领导的一个国际研究团体破解了一个关键真菌家族——曲霉菌家族的三种真菌的基因组信息，并将这些遗传信息用于新药和诊断方法的开发，这一研究分为三篇不同的文章刊登在12月22日的Nature杂志上。

这三种曲霉分别是烟曲霉（Aspergillus fumigatus）、沟巢曲霉（Aspergillus nidulans）和米曲霉（Aspergillus oryzae）。曲霉菌家族是一类在日常生活中常见由多细胞菌丝组成的菌丝体真菌，在发酵行业里常用于如酱油和酒的酿造，但是这一真菌家族中的烟曲霉（1848年）也被发现会导致白血病和骨髓移植过程中的致命性感染。

通过分析比较这些新测序出来的基因组序列信息，来自美国、英国、西班牙、日本、法国、等多国组成的研究小组惊讶地发现这三个物种只有大约68%的蛋白相同——这个比例与哺乳动物和鱼类这两种进化地位相隔4亿5千万年之间的蛋白相同度比例相同。而且这些基因组在大小上也相差得相当大：米曲霉基因组比烟曲霉基因组含量大31%，比沟巢曲霉基因组大24%，更重要的是这些9,500-14,000基因中的30%是科学家以前没有发现过的，因此也就存在了极大的研究空间。

这些基因组序列的确定有利于研究人员进一步理解曲霉菌引起的致死性和过敏性疾病的机理。而且在新药和诊断方法的开发方面，这几种关键真菌的基因组信息也对于了解过敏性疾病、肺炎以及鼻窦炎等疾病的治疗和药理学有很大的帮助。（生物通记者：张迪）


原文链接：
Nature 438, 1105-1115 (22 December 2005) | doi:10.1038/nature04341
Sequencing of Aspergillus nidulans and comparative analysis with A. fumigatus and A. oryzae
James E. Galagan1, Sarah E. Calvo1, Christina Cuomo1, Li-Jun Ma1, Jennifer R. Wortman2, Serafim Batzoglou3, Su-In Lee3, Meray Ba türkmen4, Christina C. Spevak4, John Clutterbuck5, Vladimir Kapitonov6, Jerzy Jurka6, Claudio Scazzocchio7, Mark Farman8, Jonathan Butler1, Seth Purcell1, Steve Harris9, Gerhard H. Braus10, Oliver Draht10, Silke Busch10, Christophe D'Enfert11, Christiane Bouchier12, Gustavo H. Goldman13, Deborah Bell-Pedersen14, Sam Griffiths-Jones15, John H. Doonan16, Jaehyuk Yu17, Kay Vienken18, Arnab Pain15, Michael Freitag19, Eric U. Selker19, David B. Archer20, Miguel Á. Peñalva21, Berl R. Oakley22, Michelle Momany23, Toshihiro Tanaka24, Toshitaka Kumagai25, Kiyoshi Asai25, Masayuki Machida25, William C. Nierman2,26, David W. Denning27, Mark Caddick28, Michael Hynes29, Mathieu Paoletti20, Reinhard Fischer18, Bruce Miller30, Paul Dyer20, Matthew S. Sachs4, Stephen A. Osmani22 and Bruce W. Birren1