PSI－资料档案库（PSI-MR）简介

　　

生物通报道：蛋白结构信息反应蛋白分子在健康、疾病情况下的作用，为研发新药指明方向。最近 ，美国蛋白质结构计划（PSI，Protein Structure Initiative）建立了有效pipelines用于测定蛋白的三维结构，并且正在研究新机制以用于与业界同仁分享其所获得的资源。

PSI计划由美国国立卫生研究院下属美国国家一般医学研究院(The National Institute of General Medical Sciences，NIGMS)发起，启动于2000年，为期十年。PSI已经在九月份筹建了一个资料档案库（materials repository），预计明年建立一个信息网络以方便研究人员获取、提交蛋白结构信息。

“PSI的头五年致力于研制新方法、新技术以及加快结构组装的pipelines和降低成本的途径，”NIGMS主任Jeremy M. Berg博士说，“这些研究取得的成果已经向业界开放，但是更应该注重的是新资源的可利用性。”

PSI－资料档案库（PSI-MR）

霍华德医学院蛋白组学研究所（www.hip.harvard.edu）将对PSI-MR进行管理。在研究所主任Joshua LaBaer的领导下，通过五年5百4十万美元资助，新PSI-MR将存储、上传PSI研制的蛋白表达体系，这些体系表达的蛋白可用于蛋白质结构和功能研究。研究人员也可以定购表达体系，以最低的成本完成处理、操作和传递（shipping）。

“在预测蛋白结构的实验中，构建蛋白表达体系是重要但经常也是耗时的步骤，”PSI主任John Norvell说，“通过集中一些资料的实用性，我们推出了有价值的资源，研究人员可及时免费获取，节省了研究时间。”

迄今，PSI研究中心已经构建了100，000多种表达体系。Norvell希望现有的中心每年总共能够构建出20，000种表达体系。

知识库（Knowledgebase）

2007年秋季，PSI将成立一个知识库（Knowledgebase），作为各中心获得的蛋白结构信息的总部。对于每个蛋白，研究人员都可以获得最有价值的蛋白结构和功能的信息。知识库也提供蛋白结构预测的详细实验步骤，不论这种结构是否能够成功预测。现已经过预测的PSI蛋白信息将会列成清单。除了能够获取这些细节之外，研究人员也可以向PSI提出申请对所感兴趣的蛋白结构进行预测。

PSI中心将继续向蛋白数据库（Protein Data Bank ，PDB，www.pdb.org，国际结构资料库）中输入已经预测的蛋白结构。目前，中心已经从简单和复杂有机体中得到1700多个蛋白结构，其中大部分是新类型，与PDB中其它的结构相似性很小。

技术发展
四个大规模PSI中心致力于蛋白结构预测，六个专门中心继续研发新方法和新工具，以对具有挑战性的蛋白结构，比如膜蛋白和大蛋白复合物的结构进行预测。许多技术已经在PSI首期阶段规范化、商业化，并且用于各种大、小型实验室中。这些技术创新包括：
用于表达、纯化、结晶蛋白的小型化样本；
用于对样本操作和晶体成像的遥控设备；
结构数据分析和高清晰成像的功能强大的软件；
更加精确的放映过程，检测适合成像的晶体；
用于人工合成（而非细胞表达）蛋白的改良系统。

（生物通记者 小粥）