EMBL：解读基因组数据构建的“生命之树”

　　

生物通报道：来自欧洲分子生物学实验室（European Molecular Biology Laboratory）的研究人员利用基因组数据建立了一个能自动化更新（automatable procedure）的“生命之树”，这个Tree of Life也许能帮助科学家了解进化途径。这一研究成果公布在3月3日的Science杂志上。

研究人员利用一种自动化程序研究了在191个物种中普遍出现的36个基因，找到了这些基因的共同祖先基因。首先研究人员建立了一个方法识别出5个有横向转移（horizontal gene transfer）的基因，不考虑它们，用剩下的31个基因做了一个树。然后将这些基因分别归于4个组，构成一个191个物种的8090位置的超矩阵。这样利用这个树就可以对某些进化关系以及有关现代细菌祖先的假说进行证实。这个生命之树可以帮助了解从分子网络到生物体之间的关系等进化问题，而且也为生物研究提供了一个包括识别和命名生物体、以及分类未知起源的DNA片段等的模式。
（生物通：万纹）
原文：
Science 3 March 2006:
Vol. 311. no. 5765, pp. 1283 - 1287
DOI: 10.1126/science.1123061

Toward Automatic Reconstruction of a Highly Resolved Tree of Life
Francesca D. Ciccarelli,Tobias Doerks, Christian von Mering, Christopher J. Creevey, Berend Snel, Peer Bork