基因组测序普及化时代到来?

【字体: 时间:2007年01月10日 来源:生物通

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  基因组测序普及化时代到来?

  


“我们预计将来任何实验室都能完成基因组测序工作。”

                         ——pyrosequencing技术发明者之一Mostafa Ronaghi


生物通报道:来自纽约1月2日的消息,随着454 Life Sciences的新型基因组测序仪Genome Sequencer20(GS20,见[测序新产品]GS20 升级版)进入到了越来越多的科研单位和公司,这一仪器的核心:pyrosequencing(焦磷酸测序)技术也变得越来越受到关注。

近期这一测序技术的发明者之一Mostafa Ronaghi表示希望能将pyrosequencing这一技术推广,目前Ronaghi在斯坦福医学院斯坦福基因组技术中心(Stanford Genome Technology Center)的研究团队正在致力于小型化DNA测序仪的研究,这一测序仪将采用pyrosequencing技术,而且只需要花费454仪器的一部分成本,大约50万美元。

这一仪器的材料将采用CMOS传感器代替CCD摄像机(电荷耦合式摄像机)——后者成本需要几千美元,Ronaghi表示,“这将使得成本降低到与一台PCR仪器一样,这样任何实验室都能进行基因组测序了。”

2004年,Ronaghi从美国国家人类基因组研究协会(NHGRI, National Human Genome Research Institute)获得了180万美元,为期三年的资助,用于发展基因组测序pyrosequencing array,在2006年11月中国杭州举行的国际基因组大会上,他汇报了这方面工作。

但其在基因组测序技术方面的研究实际上开始的更早,当他还是瑞士皇家理工学院(Royal Institute of Technology)的一名博士的时候,Ronaghi就已经发明了pyrosequencing技术,并拥有了相关的8项专利(包括申请中的),而且他也与其他人一同成立了Pyrosequencing公司,来使得这项技术商品化。这一公司在收购了三家公司(Personal Chemistry, Argonaut Technologies和Biotage)之后,于2003年底更名为Biotage。

2003年,454Life Sciences从Pyrosequencing公司获得了使用这一技术全基因组分析合成测序(sequencing-by-synthesis) 和焦磷酸测序(pyrophosphate-based sequencing)的5年独占授权(exclusive license),以及制作和销售相关仪器和试剂。Pyrosequencing公司保留这一技术的其它应用权利。

Ronaghi也与Illumina公司(收购了454的竞争对手:Solexa)关系密切,在进入斯坦福基因组技术中心之前(1999年),Ronaghi曾与Illumina合作获得了NHGRI2000年的$100,000资助(Phase I SBIR)。

目前454并未对这一改进作出回应。
(生物通:张迪)

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