南开大学等《PNAS》文章:基因组和蛋白质组学研究嗜热菌

【字体: 时间:2007年03月21日 来源:生物通

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  生物通报道:Geobacillus thermodenitrificans NG80-2,是一种从中国北方深层油田中分离出来的嗜热菌。来自南开大学泰达生物技术学院、天津微生物功能基因组学重点实验室、天津功能基因组学和生物芯片研究中心和南开大学生命科学学院的研究人员,对NG80-2进行了全基因组测序和蛋白质组学研究。文章刊登于3月19日网络版《PNAS》。

  

生物通报道:Geobacillus thermodenitrificans NG80-2,是一种从中国北方深层油田中分离出来的嗜热菌。来自南开大学泰达生物技术学院、天津微生物功能基因组学重点实验室、天津功能基因组学和生物芯片研究中心和南开大学生命科学学院的研究人员,对NG80-2进行了全基因组测序。文章刊登于3月19日网络版《PNAS》。

研究结果显示,NG80-2的基因组包括3,550,319 bp 的染色体和57,693 bp的质粒。NF80-2 的基因组使其具备了适应油田等各种环境的能力,能够利用多种能源,编码的运输物质能够有效地吸收能量和解毒,呼吸系统也灵活多变,包括一个由5个末端氧化酶(terminal oxidases)组成的好氧branch和一个由能够对溶氧起伏(issolved oxygen fluctuation,生物通编者译)做出快速反应的全反硝化途径(dcomplete denitrification pathway,生物通编者译)组成的厌氧branch。在此研究之前没有关于在革兰氏阳性菌中鉴定一氧化氮还原酶基因的报道。

蛋白质组学鉴别进一步证明NF80-2中存在长链烷烃降解途径,并且体内和体外实验都证实了该途径中的关键酶——长链烷烃单(加)氧酶LadA。嗜热可溶的单(加)氧酶 Lad A 是处理油污染和复杂分子生物合成的理想候选物。

文章通讯作者为南开大学王磊。

1962年出生于天津,1984年毕业于南开大学生物系微生物专业,1987年留学澳大利亚,1992年12月获得澳大利亚悉尼大学博士学位,2001年底回国。

在国外期间,王磊教授分别任澳大利亚悉尼大学研究员(Research Fellow),澳大利亚微阵列研究中心微生物检测芯片研发负责人,国际经合组织研究员。回国后现任南开大学特聘教授(****),天津市特聘教授(海河学者),博士生导师,南开大学泰达生物技术学院院长,南开大学国家微生物重点学科学术带头人,是2002年国家杰出青年基金获得者,以及国家自然科学基金委员会“微生物学学科”第十届学科评审组专家。2005年获天津市授衔专家授衔。

主要研究领域为用基因组学和功能基因组学,包括生物信息学的手段进行微生物进化和进化基因组学、细菌脂多糖功能基因、重要工业微生物和病原菌的功能基因组、致病菌的快速鉴定等方面的研究,是世界此领域中较为活跃的青年科学家。 

分别在Genetics,Infection and Immunity, Journal of Bacteriology, Journal of Clinical Microbiology,Genetics等国际微生物学重要杂志发表论文40篇,全部被SCI收录,总影响因子136,被引用次数380余次。最近分别被欧洲和美国微生物学会邀请参加编写两本总结现代微生物学发展前沿的专著。另外还申请有3项国际发明专利和94项国内发明专利 (其中二项已获授权)。 

2001年底回国至今,王磊教授领导的实验室已形成了一支由100余人组成的科研创新团队,主要从事国家“863 计划”功能基因组与生物芯片重大专项和功能基因组主题项目、国家杰出青年基金和自然科学基金项目,天津市科委重大科技攻关项目、大型国际合作项目等科研项目,研究经费共约4800万元人民币。
主要论著  

专著:

Reeves, P. R. and L. Wang (2002). "Genomic organization of LPS-specific loci." Current Topics in Microbiology and Immunology264(1): 109-135.  

专利申请 

国际专利: 

Fanrong Kong, Gwendolyn Gilbert, Lei Wang, Dan Liu, and Jiang Tao,2004, Identification of Streptococcus pneumoniae serotypes, Application N 2003901717(PCT/AU2004/000480).  

Reeves, P.R. and L. Wang, 1999, Flagellin and O antigen gene sequences from Escherichia coli serotyprs and their detection using strain-specific amplification primers. Designated for all countries. Application N WO 99-AU385 19990521.   200092
Reeves, P.R. and L. Wang, 1998, Nucleic acid molecules specific for bacterial antigens such as O antigens and their sequence and diagnostic and therapeutic uses. Designated for all countries. Application N WO 98-AU315 19980501.  


国内专利: 

鲍氏志贺氏菌7型的O-抗原特异的核苷酸(申请号:03100536.5),申请人:王磊,陶江,冯露。2003-01-20(已获授权)   659 76674
对痢疾志贺氏菌8型O-抗原特异的核苷酸(申请号:03100539.X),申请人:王磊,郭宏杰,冯露。2003-01-20(已获授权)  
(其它项申请正在审批过程中) 
详见:“科研专利” 

泰达生物技术学院论著 
学院在众多国际微生物学重要杂志发表论文40篇,全部被SCI收录,总影响因子136,被引用次数380余次。 

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