经典文章回顾:回交中的Congenic Footprint

【字体: 时间:2007年06月13日 来源:生物通

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  将敲除等位基因的小鼠与纯系小鼠进行回交是常用的生物学方法,但有可能出现未预期结果。伦敦大学国王学院(King's College London)精神病学研究所Leonard C. Schalkwyk与来自爱沙尼亚Tartu大学的同事合作,将交缩胆囊素(cholecystokynin)2敲除小鼠与C57BL/6小鼠回交,证明了“同基因印迹(congenic footprint,生物通编者译)”——邻近干细胞染色体的残存片段引起的基因表达差异。

  

生物通报道:将敲除等位基因的小鼠与纯系小鼠进行回交是常用的生物学方法,但有可能出现未预期结果。伦敦大学国王学院(King's College London)精神病学研究所Leonard C. Schalkwyk与来自爱沙尼亚Tartu大学的同事合作,将交缩胆囊素(cholecystokynin)2敲除小鼠与C57BL/6小鼠回交,证明了“同基因印迹(congenic footprint,生物通编者译)”——邻近干细胞染色体的残存片段引起的基因表达差异。

华盛顿大学病理学教授Stephen Schwartz说,在敲除研究中应该注意背静,因为要转移的是一块包含靶基因已经被敲除的基因组,而不是一小段基因组。

“两种小鼠品系就有两种不同表型。这(文章)说明除了考虑基因带来的差异外,还应该想到转移到局部基因组中的是什么。”结果,显型可能被误认为是靶基因敲除的直接结果。Schwartz强调:鉴于敲除疾病模型与报告品系(reporter strains)杂交实验很多,应该高度这篇文章,清楚knockouts 或knockins都会影响显型。(生物通 小粥)

L.C. Schalkwyk et al., “Interpretation of knockout experiments: the congenic footprint,” Genes Brain Behav, 6:299–303, Feb. 23, 2007.

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