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TaqMan®芯片可实现大规模分析小分子RNA的表达特性
【字体: 大 中 小 】 时间:2007年07月30日 来源:生物通
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加利福尼亚州-2007年7月23日-Applera公司旗下的应用生物系统(Applied Biosystems,纽约证券交易所:ABI),今天宣布推出第一个用于分析microRNA(miRNA)的TaqMan®芯片。Array Human MicroRNA Panel是一个分子工具,它可以帮助制药公司和学术机构的研究人员更迅速和更高效地搜索与疾病相关的miRNA生物标志物,加快有关microRNA如何影响生物过程的研究。通过用黄金标准的TaqMan® 来定量分析基因的表达,TaqMan芯片给使用TaqMan分析的研究人员提供了准确,敏感和可重复的实时PCR。
microRNA的都是非编码的RNA分子,能够调控基因的表达。它们在包括干细胞的分化与发育等发育和细胞生物学中发挥作用,并与包括癌症和神经系统紊乱许多不同的疾病有关。microRNA相关的研究是生物学中增长最快的一个领域。以前曾有研究显示,通过分析miRNA基因的表达模式,科学家们能够找出区别不同疾病类型的潜在miRNA生物标志物,并确定疾病的易感性。应用生物系统设计了新的miRNA TaqMan芯片,以帮助研究人员对miRNAs基因表达的图谱进行大规模的的分析,并同时检测和确定可能存在于生物样品中高达365种不同的miRNAs基因。
这个miRNA TaqMan芯片比其他分析方法需要更少数量的初始RNA样本,因而能为组织样品数量有限的研究人员提供了一个更有效的解决办法。这个芯片业使得得研究人员进行评估miRNA基因表达变化的实验,这些基因通常表达水平极低,用杂交芯片等其它技术根本就无法检测。只要有少量的起始样本,就可以开展这些实验,因为数以百计的高度敏感TaqMan® MicroRNA已镀上微卡上。TaqMan miRNA芯片的特异性使研究人员得以详细检测具有生物活性的成熟miRNA分子,并能够区分密切相关miRNAs分子,助研究人员更好地了解miRNA在细胞中发挥的具体作用。
埃默里大学医学院人类遗传部的助理教授金鹏(音译)博士正在用TaqMan Array Human MicroRNA Panel来增加样本通量,应用于大型基因表达谱,以更好地了解miRNA水平的变化如何与神经紊乱Rett综合征和脆性X综合征疾病的病理过程有什么关系。通过在小鼠的这两种疾病模型中研究miRNA如何调节神经干细胞的增殖和分化,金博士希望了解miRNAs在人类疾病病理中的作用。他指出,他用TaqMan Array Human MicroRNA在小鼠体内检测miRNAs,因为人和鼠有相当多的miRNAs是相同的。
“我们的样品通已急剧增加了”,金博士说,“在我们使用TaqMan芯片之前,我们一天只能分析大约两个样品。现在,我们可以在约两个小时分析完这些样本。使用这种技术,极大地提高了每个样品中我们可以检测的miRNA数量,以及每天我们可以检测的数量。”
TaqMan Array Human MicroRNA Panels是一个完整的体系的一部分,这个体系使研究人员得以同步进行384个实时PCR反应,而不需要液体处理机器或多道移液器。为了进行miRNA基因表达分析,研究人员使用应用生物系统的多重RT (逆转录酶)池试剂单独进行反应获得了DNA,再将这些DNA加入到miRNA TaqMan芯片中。然后使用应用生物系统的7900HT快速PCR实时系统对芯片进行分析。
“虽然发现microRNA是一个相对较新的事件,还它们的作用机理存在着许多不少未解之谜,但越来越多的研究显示,他们在不同的基本细胞过程中发挥重要的作用”,应用生物系统分子和细胞生物学消耗品事业部的副总裁Peter Dansky说,“有了这些新的miRNA TaqMan芯片,研究人员就有了快速而高度敏感的工具来大规模分析这些重要的分子,并了解它们的生物功能。