基因组学研究一览近期成果

近期来，基因组学的研究频频出成果，生物通为您介绍近期的基因组学成果。

　　

大熊猫基因组框架图绘制完成

今年3月，由中国科学家发起，加拿大、英国、美国、丹麦等国科学家联合参与的国际“大熊猫基因组研究”项目启动，绘制大熊猫基因组序列图谱是该项目的第一部分工作，深圳华大基因研究院承担了主要的工作任务。

 

10月11日，深圳华大基因研究院宣布，大熊猫晶晶的基因组框架图绘制完成，这是世界首例用短序列进行新物种测序与组装新技术完成的大型基因组序列图。

 

据介绍，从现有数据分析结果来看，数据支持了2007年科学家作出的关于大熊猫属于熊科的早期分支的结论；与已经拥有全基因组序列的物种，包括人、黑猩猩、恒河猴、小鼠、大鼠、狗、猫、牛、马、复鼠、鸭嘴兽、家鸡、斑马鱼比较的结果显示，大熊猫的基因组最接近狗，相似性接近80%，这一结果也支持熊科归于犬型亚目的分类地位。

 

大熊猫研究进入基因组时代。

 

疟原虫基因组序列绘制完成

10月9日Nature杂志出了疟原虫基因组的专题新闻。

美国纽约大学与英国Wellcome Trust Sanger研究所的科学家近期完成了两种疟原虫的测序工作。

 

Nature杂志（以疟原虫为重点）介绍了两种疟原虫的基因组序列。第一个是间日疟原虫（Plasmodium vivax）的基因组序列。第二个是诺氏疟原虫（Plasmodium knowlesi）的基因组序列。

 

测定间日虐原虫的基因组序列将会产生对其独特生物学特性的研究，而这同样有助于确定新药及疫苗开发的遗传标靶。

 

诺氏疟原虫是首个被遗传测序的猴子疟疾寄生虫，为与新近完成的间日疟原虫基因组和其它已测序的疟原虫基因组进行比较提供了新的研究机会。确定疟疾寄生虫之间的相似和不同有助于挑选遗传标靶，以进行疫苗和药物的研发。

 

详细报道请参见：Nature封面：两个重要基因图谱测序完成

http://www.ebiotrade.com/newsf/2008-10/2008109163537.htm

 

 

细菌Phenylobacterium zucineum全基因组测序

中科院北京基因组研究所的胡松年研究员和浙江大学医学院附属二院的胡讯教授合作研究的项目“细菌Phenylobacterium zucineum全基因组测序及分析”取得阶段性成果，相关论文发表在今年第9期的BMC Genomics上。

 

    P.zucineum是合作方从K562细胞系中分离到的兼性细菌。系统分类学上，该细菌属于Phenylobacterium。早期研究者发现Phenylobacterium属细菌可以把苯丙氨酸(phenylalanine)作为唯一碳源，故将该细菌属命名为Phenylobacterium。P.zucineum基因组含有苯丙氨酸代谢通路的所有关键基因，这为Phenylobacterium属细菌利用苯丙氨酸提供了遗传依据。P.zucineum能在细胞外自由生长，又能在体外培养的细胞系中长期生存，具有强大的环境适应能力。P.zucineum基因组编码大量的细胞外周sigma作用因子，转录调节蛋白，双相信号传递蛋白和热激分子伴侣等环境适应相关蛋白。这些蛋白的鉴定很好地解释了P.zucineum所拥有的强大环境适应能力。

 

另外，作为Phenylobacterium属中唯一具有全基因组序列的细菌，P.zucineum基因组序列将为细菌比较基因组学研究提供有价值的数据基础。

 

详细情况请参见：基因所胡松年新基因组测序工作完成

http://www.ebiotrade.com/newsf/2008-9/2008926160339.htm

 

 

丝盘虫基因组测序完成

美国耶鲁大学分子和进化生物学家与美国能源部的科学家合作，完成了丝盘虫的完整基因组测序。丝盘虫是自然界最原始的多细胞生物之一，该成果将给所有高等动物的进化研究提供新的借鉴。

 

　这项发表在《自然》期刊网络版上的研究表明，虽然丝盘虫是拥有最小核基因组的多细胞动物之一，但其包含的用于基因调控的特征序列可在更复杂的动物和人类身上发现。该项研究将丝盘虫定义为动物进化的一个关键点。

 

研究证明，与包含30亿个碱基对的人类核基因组相比，丝盘虫只有9800万个碱基对。较早的测序研究发现，丝盘虫的线粒体基因组的大小比那些可在绝大多数动物身上发现的要大2倍以上，这些动物具有大多数原始生物一样的基因、内含子（染色体DNA链上有许多段不表达的碱基序列，被称为内含子）及间隔序列。

 

详细情况参见：美完成丝盘虫完整基因组测序

http://www.ebiotrade.com/newsf/2008-9/200891094238.htm

 

 

小麦基因组测序完成

一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱，这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。

 

    基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息，它是通过对构成基因组的ＤＮＡ分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传信息及其在每条染色体上的相对位置线性而系统地排列出来。

 

详细报道参见：科学家绘制出首幅小麦基因组物理图谱

http://www.ebiotrade.com/newsf/2008-10/200810693113.htm