Broad研究院再添5台SOLiD系统

ABI公司近日宣布麻省理工学院和哈佛大学Broad研究院又购进了5台新的SOLiD系统。这些仪器将用于癌症和其他人类疾病的遗传学研究。加上这5台新仪器，Broad研究院的SOLiD系统数量增加至8台。

　　

ABI公司近日宣布麻省理工学院和哈佛大学Broad研究院又购进了5台新的SOLiD系统。这些仪器将用于癌症和其他人类疾病的遗传学研究。

尖端测序技术的开发为生命科学研究打开了另一扇大门，使研究人员能完整地纵览个体的全部癌症基因组。Broad研究院的科学家们正致力于创建单碱基变化（SNP）和基因组中大片段DNA重排（结构变异）的目录。利用SOLiD系统，研究小组希望将与不同癌症相关的基因组变化分类，以便更好地了解癌症的发病原因，从而改善癌症的治疗手段。

有了这5台新仪器，Broad研究院的SOLiD系统数量增加至8台。

利用现有的SOLiD系统，Broad的研究人员每一轮测序能得到134亿个碱基，超过整个人类基因组碱基数的4倍。根据ABI的数据，全新的SOLiD 3系统每一轮能产生200亿个可作图的序列数据，而在ABI的研发部门，这个数字更超过250亿。

Broad研究院基因组测序和分析项目的主管Chad Nusbaum认为：“自一年前SOLiD系统上市以来，它的技术规模已显著扩大。”他表示Broad的研究人员将在癌症基因组计划中进一步测试SOLiD的准确率和通量。

SOLiD系统为复杂的基因组和疾病研究提供了两大关键优势。首先，配对末端分析让科学家能检测与疾病相关的多种形式的结构变异。配对末端分析为读长的方向以及配对末端的距离提供了详细的信息。SOLiD系统能从一系列DNA插入大小中产生几百万个可作图的配对末端序列，来检测最多的结构变异，并精确界定某个重排的断点。其次是SOLiD系统每块玻片上超高的磁珠密度。结合巨大数量的标签和大的配对末端文库，研究人员能在每次运行后得到更高的基因组覆盖度。

SOLiD 3系统可以从现有的平台进行升级或作为一台独立的仪器，预计将在明年初全面上市。

（生物通 余亮）