冷泉港实验室《Cell》发现第五种小RNA

【字体: 时间:2008年12月01日 来源:生物通

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  来自冷泉港实验室沃森生物科学学院(Watson School of Biological Sciences),以及ISIS Pharmaceuticals的研究人员经过多年的研究,发现了一种之前未知的细胞核新RNA机制,以及一类新型小RNAs。这一研究成果公布在11月26日的《Cell》杂志上。

  

生物通报道:来自冷泉港实验室沃森生物科学学院(Watson School of Biological Sciences),以及ISIS Pharmaceuticals的研究人员经过多年的研究,发现了一种之前未知的细胞核新RNA机制,以及一类新型小RNAs。这一研究成果公布在11月26日的《Cell》杂志上。

从发现了原核生物的RNA沉默系统,到发现新类型的小分子RNA,从2006年诺贝尔医学/生理学奖花落RNA干扰,到世界首例RNAi临床实验初获成功,小分子RNA在生命科学界占据了稳稳的位置,这种体积小却作用大的分子引发了生命科学研究领域不小的震动。

在2006年,冷泉港实验室的研究人员发现了一种新型的小RNA:piRNA,即Piwi-interacting nucleotides,这种小RNA长为25-31nt,在小鼠精子发育中普遍存在,并起到了重要作用,之后研究人员接连又发现了repeat-associated siRNAs (rasiRNAs)。2007年加州大学河畔分校的华人女研究员金海玲发现了第三种小RNA:lsiRNAs,这种长为30-40nt的小RNAs被命名为“长小片段干扰RNA”(long short interfering RNAs,lsiRNAs),能在细菌感染或者特殊的生长条件下被诱导产生,lsiRNAs还有十分重要的不同之处:除了相对大一些的尺寸,lsiRNAs有独一无二的生物合成过程,以及靶标降解途径。

今年早期《Nature》又公布了一种新小RNA:内生短干涉RNA(endo-siRNAs),这些RNAs既存在于体细胞中,又存在于生殖细胞中。它们不同于miRNAs或piRNAs之处在于:前者需要的是Dcr2以及 Loqs。

在最新的这篇《Cell》文章中,研究人员发现的非编码RNA叫做MALAT1,这种RNA存在于细胞核中,能分裂成两个部分,一部分长,一部分非常短——后者就是一类新型的小RNAs,这部分小RNAs从细胞核中出来进入细胞质中,而长片段的MALAT1则仍然留在细胞核中,聚集在细胞核核斑(核斑nuclear speckles)处。

虽然目前还不清楚这些经处理的MALAT1片段的作用是什么,但是在细胞中有不同的定位说明这两部分可能执行不同的功能,领导这一研究的David L. Spector博士表示,有趣的是MALAT1是一种有效的癌症预后标志物:研究发现细胞核中有异常MALAT1表达量的癌症细胞,有扩散的倾向。

其中小片段RNAs——冷泉港实验室的研究人员将其命名为mascRNA(MALAT1-associated small cytoplasmic RNA)被Spector称为“只是一种新型小RNA冰山上的一角”,也就是说未来可能还会陆续发现许多此类的小RNAs。

研究人员在许多类型的细胞中都发现了这种保守的小RNAs,他们还发现这种小RNAs与tRNA物理形状相似,都是类似于三叶草的形状。但是不同于tRNAs,这种新型小RNAs比大多数tRNAs小,并且也没有运送的功能。Spector等人推断这种小RNAs就像是蛋白的“寄生者”,组织蛋白到达细胞中该到的地方,另一个可能就是mascRNA只是用于提醒细胞MALAT1长片段部分已经成熟了。

(生物通:张迪)

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