杰青《Genome Biol.》发mRNA新成果

　　

生物通报道：来自健康所的消息，中科院上海生命科学研究院健康研究院的研究人员在mRNA间调控网络方面取得了研究新成果，提出了一种RNA间新的相互作用机制，这一研究成果公布在《Genome Biology》杂志上。

领导这一研究的是孔祥银研究员，其早年毕业于山东医科大学医学系，后赴Max-Planck分子遗传学研究所访问，曾获得上海市科技进步一等奖，第八届中国青年科技奖，第八届中国科学院十大杰出青年等。

细胞的不同蛋白分子之间会通过不同的相互作用形成复杂的调控网络。近年来，细胞内不同RNA分子之间的关系受到了越来越多的重视。过去的研究表明长的反义转录本会影响基因的转录与翻译，但是长反义转录本在细胞的转录本中很少，相反，编码蛋白的RNA间短片段互补非常丰富。microRNA及siRNA仅约22 nt长，却能通过与目标片段的互补起到重要调控基因转录和翻译的作用，那么编码蛋白的RNA间是否存在通过短片段互补而相互作用的可能性呢？


健康所分子遗传学实验室博士生王萍等，在孔祥银研究员的指导下，并与巴斯大学Hurst教授合作，通过在人的24，968个编码蛋白的mRNA中寻找15-25 bp的互补区，发现与一系列随机序列的比较mRNA中明显富集短的配对；对区非随机分布，集于mRNA 5＇非翻译区；且，配对区的单核苷酸多态性密度低于旁侧区。这些结果表明mNA间互补短片段经历了进化选择。更重要的是配对数多的mRNA的表达值较低；组织特异表达的基因中的配对显著多于管家基因中的配对。通过与已有的小RNA的数据的比较，并没有发现mRNA间的短配对与已发现的小RNA有关， 提示其影响基因表达的作用并非通过产生小RNA实现。这一工作提示mRNA间很有可能通过短片段的配对相互作用，形成基因间相互影响的网络，是RNA间的一种新的相互作用机制。


该项工作得到了国家科技部、国家自然科学基金委和中科院项目的大力支持。

（生物通：万纹）

附：

孔祥银 研究员 研究组长
　
学习经历

1983-1988 山东医科大学医学系学士
1992-1993 协和医科大学研究生院在职研究生学习
1995-1997 Max-Planck分子遗传学研究所访问学者

工作简历

1988-1995 中国医学科学院血液学研究所 研究实习员 助研
1997-2000 中科院上海生物工程研究中心 助研，副研
2000-2002 中科院上海生物工程研究中心 研究员
2002-至今 中科院上海生命科学院上海第二医科大学健康中心 研究员　

荣誊(证书、称号、会员)

2002 国家自然科学奖二等奖
2003 上海市科学技术进步奖一等奖　

主要成果

1、成功克隆了遗传性牙本质发育不全Ⅰ型基因（DSPP），并发现该基因的部分突变还引起进行性高频耳聋，证实了DSPP 不仅参与牙本质的发育，特别是牙本质的矿化过程， 还参与了听觉系统的发育，建立了牙齿发育和内耳发育之间的联系。从而为阐明相关疾病的发生机制奠定了基础，开辟了新的思路。研究论文发表在2001《Nature Genetics》。

2、成功克隆了遗传性儿童性白内障的致病基因热休克蛋白转录因子4（HSF4）。
在国际上首次发现热休克蛋白转录因子是导致遗传性儿童性白内障的致病基因，发现HSF4蛋白DNA结合区在白内障发生中具有重要作用，首次将热休克蛋白的合成与白内障的发生联系起来为该病的诊断和治疗提供了新的理论依据，加深了对白内障发生的分子机理认识。研究论文发表在2002《Nature Genetics》。

3. 在国际上首次发现CYLD基因突变引起遗传性毛发上皮瘤。
首次发现CYLD基因的不同突变突变引起遗传性毛发上皮瘤， 研究结果于2002年上海HGM2002会议公布，论文发表于2004年《Human Mutation》。