《Nature》史无前例的“Genome 10K”计划启航

【字体: 时间:2009年11月09日 来源:生物通

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  生物通报道,眼看着第二代测序、第三代测序技术正发展地如火如荼,昂贵的基因组测序时代已经过去,旧时王谢堂前燕, 飞入寻常百姓家,如今,测序是不在话下,一项宏伟的“脊椎动物测序计划”紧接着“千人测序计划”其后于今日启航。

  

生物通报道,眼看着第二代测序、第三代测序技术正发展地如火如荼,昂贵的基因组测序时代已经过去,旧时王谢堂前燕, 飞入寻常百姓家,如今,测序是不在话下,一项宏伟的“脊椎动物测序计划”紧接着“千人测序计划”其后于今日启航。

 

千人基因组计划尚未收官,一项更为宏伟的基因组测序近期启动,这个名为“Genome 10K”的基因组测序计划将锁定脊椎动物的基因组,绘制上万种脊椎动物的基因组图谱。

 

这项Genome 10K计划于115日公布在Journal of Heredity上,计划宣称,将测定万种脊椎动物基因组图谱,用于研究生物多样性和动物进化的机制。

 

主要负责人之一,David Haussler表示,我们发现脊椎动物群是一个的具有十分丰富的多样性资源的群体,从海牛到食蚁兽,各式各样的脊椎动物出现在世界上,研究这些脊椎动物的基因库将有助我们了解人类进化史和动物演化的各种模式。

 

据介绍,来自California大学的David Haussler,国立癌症研究所的Stephen O’Brien,和来自California 动物园的Oliver Ryder,上述3人为该项目的主要发起人和负责人。此外,来自5个国家的68位科学家将参与到这项计划中,43个研究机构参与其中。最终将测定16,000种脊椎动物的基因组图谱。

 

这个计划是千人基因组计划的一个延展。

 

2008年“千人基因组计划”正式启动。这一宏伟计划将测定选自全世界各地的至少一千个人类个体的全基因组DNA序列,绘制迄今为止最详尽的、最有医学应用价值的人类基因组遗传多态性图谱。

 

“千人基因组计划”将采用几种新的高通量测序平台。若使用目前标准的DNA测序技术,同样的工作可能需要花费5亿美元以上。然而,由于该计划的创造性的努力,建立了更高效更低价的新测序技术,“千人基因组计划”的发起者希望这一计划的成本最终将降低至3000万到5000万美元。

 

“千人基因组计划”将测序的人群包括:尼日利亚伊巴丹区域的Yoruba人;居住于东京的日本人;居住于北京的中国人;美国犹他州的北欧和西欧人后裔;肯尼亚WebuyeLuhya人和KinyawaMaasai人;意大利的Toscani居民;居住于休斯顿的Gujarati印第安人;居住于丹佛的中国人;居住于洛杉矶的墨西哥人后裔;居住于美国西南部的非洲人后裔。

(生物通 小茜)

 

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10,000 genomes to come

Results are just beginning to arrive for the 1000 Genomes Project, a genomic study of human diversity. However, an international group is already planning something even more ambitious — a 10,000 genomes project. The initiative, called Genome 10K, aims to tackle thousands of vertebrate species.

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