LC Sciences进入新兴的序列富集市场

　　

上周，来自美国德克萨斯州的LC Sciences公司宣布推出可应用于新一代测序的定制靶序列富集服务(Custom Target Enrichment Service)。

LC Sciences现在提供一项名为靶标特异性筛选服务，用于捕获指定的基因组区域或RNA序列。此项服务基于µParaflo生物芯片技术，通过降低样品复杂度同时专注于感兴趣的区域，可获取更广的覆盖度与更深的测序深度，从而使研究人员能更好地发挥第二代高通量测序的优势。

通过推出这项服务，LCS已决定进入被称为序列捕获、靶标富集或是序列富集的新市场。提供该服务的公司还包括： Aglient，Roche，NimbleGen，Febit以及RainDance公司。他们对此项服务的命名尚未达成一致，但他们都赞同这个市场具有巨大的潜力，用LCS的话讲，“非常之大”。

第二代测序技术“将为研究人员提供许多新机会，我们已经能够预见这一市场将会迅速发展；它将变得十分巨大。”Chris Hebel，LCS的商业发展总监，上周告诉BioArray News。

“显然靶标特异性筛选的市场也将会变得非常大，”Hebel说。“这个市场是我们技术服务的延伸。我认为微阵列或此项技术的应用是对测序技术的良好补充，”他说。“如果你可以将样品复杂度降低到可以在单次测序反应中运行多个样品，并能获取所需的所有读数(reads)，那么你就可以省下大量的经费。”

据Hebel所说，新兴的靶标特异性筛选市场正是微阵列可服务于第二代测序技术平台的最好证明。“现在，大家对于测序是否会取代微阵列存在大量的讨论，而这正是它们两者之间可以互补的证明；阵列可以使测序费用变得更加经济。”

 

μParaflo^Ò微流体技术

LC Sciences可在一个由程序控制的高密度微流体芯片上定制合成寡核苷酸序列，这些序列可以作为对任意基因组或转录组的靶区域进行特异性捕获的探针。

将样品杂交至微阵列上，去除不需要的序列，之后可从芯片上回收捕获的靶序列。这些回收的靶序列可直接用于高通量测序或作进一步的处理。

LCS同时也提供溶液内靶标筛选服务。合成生物素标记或磷酸化的寡核苷酸，并将它们设计成以特定基因组区域为靶标的探针。当这些探针与样品完成杂交后，向溶液中加入磁珠，捕获探针即吸附至磁珠上。通过清洗磁珠，去除其它非靶序列，然后回收获取靶序列。

LCS的服务适用于目前所有的第二代测序仪，包括Roche/454 FLX，ABI SOLID，Illumina (Solexa) GA测序仪等。

“这个市场是我们技术的延伸……我们的微阵列具有两大优势，一是平台的灵活性高，二是基于我们的合成化学和微流体设计，我们的探针合成质量非常高。”Hebel说。

Hebel说，基于这一技术，LCS把每个项目都当作是定制项目来对待。“每一份定单都是不同的。每一位客户的需求都是独特的。所以我们产品的灵活性对于这一应用是十分有效的”他说。“合成是完全定制的，我们可以合成任意序列或基因组。我们不需要进行其它设置，所有操作都是数字化的，因此单个阵列的合成非常快。”

他认为这种灵活性可以使LCS领先于其它竞争对手。“在这项应用的早期发展阶段，定购阵列的客户是很少的。设计阵列，获得结果，然后他们的实验就完成了”Hebel说。“更具代表性的是，第一轮实验的结果会使他们需要更多新设计的微阵列”，“对于这一应用来说，能够快速设计和制备阵列是十分必要的。”

Hebel表示，LCS预计溶液内靶序列筛选将会越来越受用户欢迎。“从长远来看，溶液内序列捕获将会变得更有意义……对于标准设计筛选项目来说，”Hebel说。“不需要更多的费用，我们可以合成捕获探针，它们可以在溶液中一次性筛选数以千计的样本，而不需要为每个样本单独合成阵列。”

Hebel坦陈，LCS在靶序列筛选市场正面临着其它公司的竞争，正如microRNA微阵列市场一样，LCS，Agilent和Febit同样也提供miRNA阵列。

“目前许多公司都对这一市场感兴趣，但只有能够提供可靠的结果并满足客户需求的公司才能掌控市场，我们觉得我们可以做到这一点。”Hebel说。

Hebel补充说，LCS已决定专注于提供服务，而不是销售产品，因为客户对此项工具的使用还不具备足够的经验。“很多人仍然害怕使用微阵列，他们宁可专注于获得实验结果，而不是去弄明白它是如何工作的。”他说。

 

关于LC Sciences与联川生物

LC Sciences（美国）是一家专业提供基因组及蛋白质组产品与服务的生物技术公司，提供全方位的DNA，RNA及多肽微阵列服务，可用于核酸/蛋白表达谱与功能分析，生物标记发现和新药筛选，研发应用于诊断和生物传感的微型实验设备。基于专利的µParaflo^®微流体技术，LC Sciences可提供具有高度灵活性和定制化的创新产品来满足客户快速变化的需求。联川生物作为LC Sciences在中国成立的全资子公司，随时为您提供最新的生物技术服务和前沿信息。