博导新文章:DNA片段确定分类

【字体: 时间:2009年06月15日 来源:生物通

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  中科院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室陈之端研究组利用四个DNA片段(rbcL、matK、trnL-F和26S rDNA)和65个广义形态学形状重建毛茛目的系统发育关系,并更新了毛茛目的分类系统。该成果发表在《植物生态学、进化与分类学展望》(Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics (2009, 11: 81-110))杂志上。

  

来自中科院植物研究所的消息,中科院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室陈之端研究组利用四个DNA片段(rbcL、matK、trnL-F和26S rDNA)和65个广义形态学形状重建毛茛目的系统发育关系,并更新了毛茛目的分类系统。该成果发表在《植物生态学、进化与分类学展望》(Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics (2009, 11: 81-110))杂志上。

毛茛目(Ranunculales) 是真双子叶植物最基部的分支之一,在被子植物大类群演化中起着承前启后的作用,系统位置极为关键。通过选取毛茛目7科99属植物,利用最大简约法和贝叶斯法,在属的水平上构建了毛茛目的系统发育关系。根据所建立的高置信度的系统发育框架,重新界定了毛茛目各科及科内亚科或族;探讨了不同分类阶元的鉴别性性状;澄清了目内一些孤立属的系统位置和分类等级。综合分子和形态学证据,更新了毛茛目的分类系统,包括把防己科划分为两个新的亚科(Menispermoideae and Tinosporoideae),为毛茛科的美花草属(Callianthemum)建立了一新族Callianthemeae。

该研究成果对理解毛茛目进化的大格局和进化的脉络,以及理解整个被子植物,特别是真双子叶植物的多样性和花部式样的演化规律有重要意义。

附:

陈之端

职称:
研究员、博士生导师

出生地:
山东省鱼台县

出生年月:
1964年5月

1985年毕业于山东大学生物系。1992年8月在中国科学院植物研究所获得博士学位并留所工作,先后任研究实习员、助理研究员、副研究员,1997年起任研究员,1999年起任博士生导师。
 
目前担任中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室植物系统发育重建创新研究组组长、《植物分类学报》主编。1995年在美国佛罗里达大学进行合作研究。1999、2000、2002和2006年曾分别在瑞士苏黎世大学、英国邱园、美国哈佛大学和美国华盛顿史密森研究所作短期访问学者或合作研究。近年来一直从事的研究领域是植物系统发育重建和生物地理学,即利用多学科的手段,在较高分类阶元上,探讨植物的系统发育关系和演化,并将形态学、古植物学和分子系统学的研究结果相结合,研究植物类群的起源、分化和现代地理格局及其成因。目前的主要研究工作集中在:

(1)在传统的分类学基础上,对分类群进行DNA自动鉴定,即DNA Barcoding;

(2)利用基因和基因组数据,重建分类群的系统发育关系;

(3)利用发育生物学实验技术,研究关键创新性状的功能和进化。

曾主持完成过国家自然科学基金委青年基金和美国国家地理学会(NGF)基金项目各1项,国家自然科学基金委面上项目3项,还分别与路安民研究员和吴征镒院士共同主持过国家基金委重点项目各1项,作为合作者与美国密西根大学仇寅龙博士合作完成一项国家基金委海外青年学者合作基金项目。正在主持中国科学院知识创新方向性项目一项。参加科技部国家重点基础研究发展计划项目(973)和国家自然科学基金委基金重点项目各一项。2005年获云南省自然科学一等奖一项(本人排名第二)。已在国内外SCI收录期刊上(如AJB,DGE,IJPS, MBE, MPE,Nature, NP,PNAS等)上单独或合作发表论文60余篇。
 

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