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上海巴斯德所PLoS ONE取得疾病研究进展
【字体: 大 中 小 】 时间:2009年07月29日 来源:
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通过对上海急性呼吸道感染儿童病人分离的鼻病毒基因组的详细研究,中科院上海巴斯德研究所杜文圣研究员(Vincent Deubel)领导的新生病毒研究组和巴黎巴斯德研究所的科研人员首次在一种新病毒-鼻病毒C中发现大量多重重组。该重组使得鼻病毒具有高遗传变异性。同时还发现,该重组出现在不同亚型鼻病毒共感染的病人组织中。从儿童支气管炎和肺炎病人鼻咽喉样本分离到的病毒中发现鼻病毒重组的数量非常大,这增加了我们对该病毒正在进化以适应于宿主和环境趋势的担忧。这项工作发表在2009年7月27日的PLoSONE杂志上。
来自巴斯德所的消息,通过对上海急性呼吸道感染儿童病人分离的鼻病毒基因组的详细研究,中科院上海巴斯德研究所杜文圣研究员(Vincent Deubel)领导的新生病毒研究组和巴黎巴斯德研究所的科研人员首次在一种新病毒-鼻病毒C中发现大量多重重组。该重组使得鼻病毒具有高遗传变异性。同时还发现,该重组出现在不同亚型鼻病毒共感染的病人组织中。从儿童支气管炎和肺炎病人鼻咽喉样本分离到的病毒中发现鼻病毒重组的数量非常大,这增加了我们对该病毒正在进化以适应于宿主和环境趋势的担忧。这项工作发表在2009年7月27日的PLoSONE杂志上。
鼻病毒和流感病毒,呼吸道合胞病毒是儿童呼吸感染主要致病病毒。鼻病毒分为3种亚型:即HRV-A, HRV-B和HRV-C亚型。2006年美国首次发现了HRV-C。上海巴斯德研究所新生病毒研究组研究人员与上海南翔医院儿科合作,通过系统研究急性呼吸道感染致病病毒,发现HRV-C在所有鼻病毒感染病例中占50 %以上。其中,一半以上含有一个长度不一属于HRV-A的5’端的基因片段。该发现表明HRV-C可以分为两个新亚种。通过新亚种全基因组测序,研究人员还发现了基因组其他位置的重组点。此外,分析表明HRV-A和HRV-C共感染可能是产生病毒重组的原因。
本研究同时证明儿童人群存在鼻病毒高遗传多样性,该样本人群在同一医院就诊,来自有一百万居民的同一社区,其中40%是外来人口。这表明,鼻病毒在这样的社区内有很高的进化能力。 鼻病毒C主要是在支气管炎和肺炎门诊儿童病人中发现的,然而,重组导致5 '端非编码区二级结构变化对病毒扩增周期的影响尚未确定,因为它无法进行细胞培养也不能感染小鼠。
这项研究首次提出,与脊髓灰质炎病毒相似,不同鼻病毒有重组能力。导致极大的病毒多样性,从而使病毒诊断和分离更加困难。
这项研究的结果提示我们,应进行全球范围的鼻病毒亚型的病毒学监测。
这项工作得到了法国发展署、李嘉诚基金会资助的“急性呼吸道感染研究行动计划”和“东南亚流行病状况调查与监测”两个国际合作项目以及国家科技重大专项“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”的支持。(巴斯德所)
附:
杜文圣研究员
教育经历
1985年: 法国巴黎第七大学科学博士(病毒学)
1973年: 法国奥尔良大学第三阶段博士(生物物理)
1971年: 法国奥尔良大学科学硕士(生物化学)
任职经历
2004-至今 中科院上海巴斯德研究所所长,新生病毒研究组负责人
2001-2004 法国里昂巴斯德研究所病毒性传染病室负责人(国家参照中心及世界卫生组织虫媒病毒流行性出血热合作中心)
2000-2003 里昂"让.梅里约"P-4 实验室科学主任 里昂梅里约-巴斯德研究中心科学主任
1999-2000 法国巴黎巴斯德研究所病毒学部主任
1993-2000 法国巴黎巴斯德研究所虫媒病毒和流行性出血热室负责人(国家参照中心及世界卫生组织合作中心)
1989-1992 法国巴黎巴斯德研究所虫媒病毒实验室主任(国家参照中心及世界卫生组织合作中心)
1987-1988 法国巴黎巴斯德研究所分子病毒学实验室副教授(Marc Girard教授)
1985-1987 美国科罗拉多州科林斯堡疾病控制中心分子病毒学实验室研究人员(Dennis W Trent教授)
1979-1985 塞内加尔达喀尔巴斯德研究所病毒实验室主任
1977-1979 法国巴黎巴斯德研究所病毒生态学实验室研究助理(Claude Hannoun教授)
研究方向
1.致病病毒研究
本研究组正在开发病毒组学研究平台来确定和辨别来自急性呼吸道感染和脑炎患者的病理标本中的新病毒。我们利用序贯诊断检验分析确定病毒,方法包括多重RT-PCR、结合免疫荧光的病毒细胞培养、使用病毒特异抗体的电子显微镜、病毒基因组DNA芯片分析测序和系统分析。由于野生动物可以携带具有潜在人类传染性的动物病毒,这些方法也可应用于针对野生动物的研究。我们已经与上海当地医疗单位(瑞金医院、中山医院)和大学(华东师范大学)建立了合作研究计划,并与巴斯德研究所国际网络合作提高病毒诊断技术。此外,为深入了解地区性和流行性儿童急性病毒性呼吸道感染的特征,我们开展了病毒起源和发生的流行病学和遗传学研究。我们还开发了蛋白质组学平台用于病毒蛋白和单克隆抗体制备,来辨别主要抗原表型、确定细胞受体结合域和开发血清学诊断试剂盒。
2.流行性乙型脑炎黄病毒研究
流行性乙型脑炎(日本脑炎)病毒致病的分子基础研究是我们的另一研究重点。在亚洲国家,该病毒是一种蚊媒病毒,通过鸟类和猪传播,最终引起人类感染,导致脑炎和死亡。据估计,每年约有30000人感染,其中约三分之一的患者死亡。在中国,一种有效的减毒疫苗SA14-14-2被应用于儿童接种。令我们感兴趣的是,中法同行们通过将编码免疫株不同蛋白的基因中的突变引入致病性亲代病毒基因组的感染性cDNA克隆,确定了减毒作用的分子标记。显型标记物也已被开发用于比较重组病毒的神经侵染性和神经毒性。同时,我们也对理解分泌性可溶性的病毒非结构糖蛋白NS1六聚体在疾病发病程度中的作用感兴趣。目前,NS1是否与日本脑炎病毒的神经侵染性和/或神经毒性有关仍然未知。要解答这一问题,我们正在与成都生物制品研究所、中国疾病预防与控制中心、中国药品生物制品检定所,巴黎巴斯德研究所等单位合作研究蛋白结构及其在病毒致病性中的生物学作用机制。