杰青女科学家09连发多篇文章

　　

生物通报道：早年毕业于湖南师范大学生物系的曾嵘博士2004年获得国家“杰出青年”基金，2005年1月被聘为Proteomics编委。2005年9月被选为国际人类蛋白质组组织(HUPO)理事会委员。2006年起担任 Molecular and Cell Proteomics 编委。2005年获得中国青年女科学家奖。

其研究小组主要致力于发展蛋白质组研究技术和建立大规模蛋白质组研究平台，近来获得了几项研究成果：

通过同步定量细胞蛋白质组及磷酸化蛋白质组揭示蛋白质磷酸化和基因表达间的关系

8月12日, 国际知名学术期刊Molecular and Cellular Proteomics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所/系统生物学重点实验室曾嵘研究组的工作：运用阴阳多维液相色谱-质谱系统和稳定同位素标记的方法，同步定量细胞蛋白质组及磷酸化蛋白质组，从而系统地揭示了蛋白质磷酸化和基因表达间的关系。该项工作是与吴家睿研究组和李亦学研究员领导的生物信息中心合作完成的，并得到了科技部，基金委和中科院经费支持。

磷酸化是蛋白质最重要的翻译后修饰之一,磷酸化肽段和非磷酸化肽段的不同特性，使得磷酸化肽段和非磷酸化肽段的同步鉴定及定量成为蛋白质组学研究中的难点。生化与细胞所博士生伍一博等人在曾嵘研究员指导下，运用该实验室发明的阴阳多维液相色谱-质谱系统(Yin-Yang-MDLC-MS/MS)及在线pH梯度洗脱对细胞内蛋白质酶解肽段进行分级分离，实现了一次实验中对磷酸化肽段和非磷酸化肽段的同步鉴定。进一步结合稳定同位素标记 (SILAC)的方法，可以同步定量细胞内蛋白质表达及其磷酸化水平。对于单个蛋白质而言，这一方法有助于区分两种不同的磷酸化水平改变方式，即直接受激酶调控，或者通过蛋白质表达量的变化而变化。从系统水平上看，这一方法可以揭示转录因子磷酸化对其下游靶基因的调控关系。该工作以脂肪细胞为研究对象，鉴定到了一些在分化早期磷酸化水平或表达量发生显著变化的蛋白质，进一步的生物信息学分析揭示了一些转录因子磷酸化水平与下游靶基因表达水平的关系。这一工作为系统水平上诠释脂肪细胞分化早期分子事件提供了研究策略和实验依据，发展的技术方法也可以广泛应用于信号转导分子机制研究。


系统的蛋白质翻译后修饰数据在线分析平台-SysPTM

蛋白质翻译后修饰，是调节蛋白质生物学功能的关键步骤之一。更重要的是，在一个生物系统中，往往有多种修饰同时协同发挥作用。近年来，高灵敏度、高准确性和高通量的质谱分析实现了对蛋白质翻译后修饰的大规模鉴定，大大扩展了实验确认的蛋白质翻译后修饰种类和数量。

在这篇文章中，研究人员开发了一个系统的蛋白质翻译后修饰研究数据平台。该平台首先将分散在公共数据库和文献中的实验鉴定的多种蛋白质翻译后修饰信息整合，建立了一个目前最完整的蛋白质翻译后修饰数据库，包括了近50种修饰类型，33421个蛋白质上的117349个修饰位点。在此数据基础上，SysPTM又开发了四个在线工具（PTMBlast，PTMPathway，PTMPhylog，PTMCluster），用户可以在线分析和比较各种翻译后修饰的功能和保守性等性质。该数据库为深入分析蛋白质翻译后修饰奠定了基础，在线工具也为解析高通量蛋白质修饰数据提供了有力支持。

这项研究成果有利于对蛋白质翻译后修饰进行大规模鉴定，解决蛋白翻译后修饰数据分析问题。这一研究成果公布国际知名学术刊物Molecular and Cellular Proteomics在线版上。

附：
曾嵘

研究员，研究组长，博士生导师

电话：54920170
E-mail: [e-mail]


个人简介：
1995年毕业于湖南师范大学生物系；2000年毕业于中科院上海生物化学研究所，获生物化学与分子生物学博士学位；2000年-至今在中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所蛋白质组研究分析中心工作，现为中心执行主任。2004年获得国家“杰出青年”基金，2005年1月被聘为Proteomics编委。2005年9月被选为国际人类蛋白质组组织(HUPO)理事会委员。2006年起担任 Molecular and Cell Proteomics 编委。2005年获得中国青年女科学家奖。

研究方向：蛋白质组学与蛋白质动态行为

研究工作：
细胞内的蛋白质的表达，修饰，空间位置和相互作用是随时间，空间和环境因素动态变化的，因此用静态的或单一条件来进行研究显然不符合生命的动态性特征。更重要的是，蛋白质在各个层次上的变化可以相互影响，进而最终影响蛋白质或蛋白质群的功能。这种蛋白质多层次的变化总称为蛋白质动态行为。可以说，蛋白质的动态行为是生命复杂性，动态性和整体性的分子基础。研究如此复杂的蛋白质动态行为首先需要高通量，定量化和整体水平的研究技术。
曾嵘研究员领导的研究组致力于发展蛋白质组研究技术和建立大规模蛋白质组研究平台。近年来，在高通量蛋白质鉴定及修饰分析，蛋白质定量，亚细胞蛋白质分析和蛋白质相互作用等蛋白质组研究方法和技术上进行探索。采用定量化研究手段研究细胞分子网络，疾病动物模型等系统中的蛋白质动态行为，并采用计算生物学手段构建蛋白质动态行为及其调控模型。目前研究的细胞模型主要为3T3L1脂肪细胞分化等系统，动物模型主要为糖尿病大鼠等系统。