曹晓风实验室《PNAS》拟南芥研究取进展

【字体: 时间:2010年10月28日 来源:生物通

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  近日中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风实验室以模式植物拟南芥为材料,结合蛋白组学、转录组学和遗传学等研究手段,揭示了对称性双甲基化在mRNA前体拼接过程中的重要作用,阐释了AtPRMT5参与调控植物生长发育过程的分子机制。研究成果在线发表于国际知名期刊《美国科学院院刊》(PNAS)上。

  

    近日中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风实验室以模式植物拟南芥为材料,结合蛋白组学、转录组学和遗传学等研究手段,揭示了对称性双甲基化在mRNA前体拼接过程中的重要作用,阐释了AtPRMT5参与调控植物生长发育过程的分子机制。研究成果在线发表于国际知名期刊《美国科学院院刊》(PNAS)上。

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    领导该项研究的曹晓风博士早年就读于北京大学生命科学学院。2002年曾入选中科院“****”,2003年获国家杰出青年基金,2006年在“****中期评估中获得优秀,2008年获得美国杜邦青年科学家奖。现任中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因中心副主任。其研究小组的主要科研方向为DNA及组蛋白甲基化和小分子RNA调控机理。

    蛋白质是生物体结构与功能的基本单位,是所有生命活动的物质基础和生理功能的重要执行者。蛋白质翻译后修饰是调节蛋白质生物学功能的关键步骤之一,作为基因产物几乎所有的蛋白质都要经过翻译后的剪切修饰才能成为成熟蛋白质。目前已发现的蛋白质翻译后修饰形式已经多达100种以上,其中蛋白质精氨酸甲基化是一种非常重要的蛋白翻译后共价修饰,参与调控细胞的多种重要的生命过程。蛋白质精氨酸甲基化由一类被称为蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMT)的蛋白家族催化完成,主要分为非对称性双甲基化(I型)和对称性双甲基化(II型)。AtPRMT5是拟南芥中一个主要的II型蛋白精氨酸甲基转移酶,能够催化组蛋白和非组蛋白的对称性双甲基化,参与调控植物生长发育的各个过程,包括叶片形态、生长速率、以及通过下调开花抑制基因FLC的表达而促进开花等过程。但是目前,对于AtPRMT5参与植物生长发育的分子机制的认识还非常有限。
  
    曹晓风研究员及其研究团队利用蛋白组学手段,鉴定了AtPRMT5的体内非组蛋白底物,其中包括一些与RNA代谢相关的蛋白。随后利用高通量转录组测序技术(RNA-seq)来检测RNA代谢的变化。研究结果表明AtPRMT5的缺失会导致大量的mRNA前体的拼接出现异常,而这些mRNA参与植物生长发育的多个过程,如非生物刺激响应,光合作用,温度响应等。以开花时间调节为例,在atprmt5突变体中,开花调节基因FLK(FLOWERING LOCUS KH DOMAIN)的异常拼接会导致其正常功能转录本的减少和蛋白水平的下降,从而造成FLC的上调以及晚花的表型。由此可知,AtPRMT5通过调控植物生命周期各个阶段中mRNA前体的正确加工,保证了植物正常的生长发育过程。

    拟南芥精氨酸甲基转移酶AtPRMT5的功能研究为AtPRMT5介导的对称性双甲基化参与调节mRNA前体拼接提供了体内的直接证据;同时为深入开展PRMT5的研究提供了全新的思路,将其功能从转录调节水平扩展到了转录后调节水平,具有重要的参考意义。

此项研究得到了重大研究计划、973和国家自然科学基金项目的资助。

(生物通:何嫱)

作者简介
曹晓风
植物基因中心副主任,研究员,博士生导师
E-mail: xfcao@genetics.ac.cn
研究方向:DNA 及组蛋白甲基化和小分子RNA 调控机理

学习经历:
1984-1988 北京大学生物系 学士
1988-1991 中国农业大学生物学院 硕士
1993-1997 北京大学生命科学学院 博士

工作经历
1991-1993 北京大学生命科学学院 助教
1993-1997 北京大学生命科学学院 讲师
1995-1996 英国John Innes Centre 访问学者
1997-1998 美国华盛顿州立大学生化研究所 博士后
1999-2003 美国加州大学洛杉矶分校 助理研究员
2003-今 中科院遗传与发育生物学研究所 研究员

获奖情况
2008年获得美国杜邦青年科学家奖 2006年“****”终期评估中获得优秀 2003年获国家杰出青年基金 2002年入选中科院“****

主要研究领域:
1.拟南芥中的组蛋白甲基化与开花时间调控的分子机理研究
2.高等植物中small RNA的合成途径调控机理研究

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