华大基因将测序100种脊椎动物

　　

在本月召开的冷泉港基因组生物学会议（Biology of Genomes meeting）上，深圳华大基因研究院董事长杨焕明院士宣布，华大基因计划在未来两年内对100种脊椎动物的基因组进行测序，作为国际性“Genome 10K计划”的一部分。

Genome 10K计划于去年11月5日公布在《Journal of Heredity》上，计划宣称，将测定万种脊椎动物基因组图谱，用于研究生物多样性和动物进化的机制。科学家们将这一项目成为基因组动物园（Genome zoo），它将成为哺乳动物、鸟类、爬行类、两栖类和鱼类等10000个物种的DNA序列数据库。

来自加利福尼亚大学的David Haussler，国立癌症研究所的Stephen O’Brien，和来自加利福尼亚动物园的Oliver Ryder为该项目的主要发起人和负责人。此外，来自5个国家的68位科学家将参与到这项计划中，43个研究机构参与其中。

杨教授表示，华大基因将在中国解决Genome 10K的最初100个基因组。待测序的物种将根据系统发育多样性、样品可用性、生物学相关性等进行选择。

据Stephen O’Brien介绍，华大基因将采用Illumina公司的HiSeq 2000平台进行脊椎动物的测序。在今年早期，华大基因订购了128台Illumina新的HiSeq 2000测序平台。华大基因的这笔订单是Illumina的第一笔HiSeq 2000订单，也是迄今为止签下的最大一笔。128台仪器中的大部分将放在新开的香港基因组中心。Illumina将在今年第一季度开始安装仪器，剩下的仪器将会在接下来的三个季度中陆续交付。

Genome 10K计划的目标是以5000万美元完成10000个脊椎动物的测序。这要是放在10年前，根本连想都不敢想。现在得益于第二代、第三代测序技术的发展，基因组的测序费用已降低至1万美元以下。不过，费用还需降低一半，才能达到Genome 10K计划的目标。（生物通 余亮）