中山大学Nature Genetics文章:解析AS易感位点

【字体: 时间:2011年12月06日 来源:生物通

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  12月4日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上刊登了一篇中国科学家的论文,他们利用先进的全基因组关联分析技术(GWAS)在中国汉族人群中鉴定出了强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)的两个新易感基因位点。

  

生物通报道  12月4日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上刊登了一篇中国科学家的论文,他们利用先进的全基因组关联分析技术(GWAS)在中国汉族人群中鉴定出了强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)的两个新易感基因位点。

整个研究项目是由中山大学附属第三医院、中山大学肿瘤防治中心、新加坡国立大学、新加坡科技研究局(Agency for Science ,Technology and Research,简称 A*STAR),华中科技大学等二十多家医疗研究机构的研究人员共同协作完成。中山大学附属第三医院的古洁若(Jieruo Gu)教授和新加坡科技研究局的刘建军(音译,Jianjun Liu)为这篇文章的共同通讯作者。

强直性脊柱炎是一种类风湿因子阴性、累及脊椎等中轴关键和肌腱韧带骨附着点的慢性炎症性疾病。此病在白种人中的发病率为0.1%-0.3%,黄种人中的发病率约为0.2%,好发年龄为10-40岁。此病发病隐匿,进展缓慢。早期90%的患者主诉腰痛,接着肌腱或韧带骨附着点出现炎症,然后出现晨僵、腰椎各方向活动受限和胸廓活动度减少,后期出现脊柱强直。家系研究发现,AS存在明显的家族聚集倾向,被列入多基因遗传病范畴。

在这篇文章中,研究人员首先对6068名受试者(其中包括1,837名强直性脊柱炎患者,以及4,231名未患该病的对照个体)的1,356,350个常染色体SNPs进行了全基因组关联分析,在随后的研究中进一步对另一组 5596名受试者(其中包括2,100名强直性脊柱炎患者,以及3,496名对照个体)的30个潜在SNPs进行了分析。他们鉴别出了两个新的基因位点,一个位于染色体上5q14.3区域EDIL3与 HAPLN1基因间位点(rs4552569; P = 8.77 × 10−10),另一个是12q12区域的ANO6基因(rs17095830; P = 1.63 × 10−8)。此外,研究人员还验证了从前在欧洲家系中报道的强直性脊柱炎与MHC区域(top SNP, rs13202464; P < 5 × 10−324)和2p15区域的关联性。研究数据证实MHC区域的rs13202464显示了了中国汉族人群HLA-B*27 变异体 (包括HLA-B*2704, HLA-B*2705 and HLA-B*2715)的风险效应。

这些研究发现对科学家们更深入地了解汉族人群强直性脊柱炎发生的分子机制,探索强直性脊柱炎风险预测,并为未来强直性脊柱炎的诊断、治疗、新药研发提供了新的靶点。

(生物通:何嫱)

生物通推荐原文摘要:

A genome-wide association study in Han Chinese identifies new susceptibility loci for ankylosing spondylitis

To identify susceptibility loci for ankylosing spondylitis, we performed a two-stage genome-wide association study in Han Chinese. In the discovery stage, we analyzed 1,356,350 autosomal SNPs in 1,837 individuals with ankylosing spondylitis and 4,231 controls; in the validation stage, we analyzed 30 suggestive SNPs in an additional 2,100 affected individuals and 3,496 controls. We identified two new susceptibility loci between EDIL3 and HAPLN1 at 5q14.3 (rs4552569; P = 8.77 × 10−10) and within ANO6 at 12q12 (rs17095830; P = 1.63 × 10−8). We also confirmed previously reported associations in Europeans within the major histocompatibility complex (MHC) region (top SNP, rs13202464; P < 5 × 10−324) and at 2p15 (rs10865331; P = 1.98 × 10−8). We show that rs13202464 within the MHC region mainly represents the risk effect of HLA-B*27 variants (including HLA-B*2704, HLA-B*2705 and HLA-B*2715) in Chinese. The two newly discovered loci implicate genes related to bone formation and cartilage development, suggesting their potential involvement in the etiology of ankylosing spondylitis.

作者简介:

古洁若

女,主任医师,教授,风湿免疫科主任,学科带头人,博士生导师,国务院特殊贡献津贴专家,国家自然科学基金杰出青年基金获得者。现任中华医学会风湿病学分会副主任员、广东省医学会风湿病学分会主任委员、《中华风湿病学杂志》副总编辑、国际强直性脊柱炎专家委员会成员、美国风湿病学会国际会员。先后负责国家863项目、国家自然科学基金、卫生部临床学科重点项目、教育部博士点基金等十余项国家级及省部级课题。曾赴美国加州大学洛杉矶分校风湿病研究中心留学三年。医疗特长:从医从教近30年,对各种风湿性疾病的诊断和治疗有较深的造诣,尤其对脊柱关节病、强直性脊柱炎及其他各种疑难风湿性疾病有丰富的临床经验。

获奖情况:
国务院特殊贡献津贴专家,国家自然科学基金杰出青年基金获得者。先后负责国家863项目、国家自然科学基金、卫生部临床学科重点项目、教育部博士点基金等十余项国家级及省部级课题 。卫生部科教司“教书育人,管理育人,服务育人“先进个人荣誉奖”。

论著:
多年来在国内外共发表论文100余篇,其中在 Arthritis & Rheumatism 等 SCI 收录杂志中发表第一 / 通讯作者20余篇。

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