张亚平院士最新文章分析遗传多样性

　　

生物通报道：来自中科院昆明动物研究所的研究人员对来自3个群体的共计285份黎族样本的线粒体DNA（mtDNA）遗传多样性进行了分析。结合之前发表的数据，研究结果显示海南岛人群与广西人群的遗传关系较为密切；来自大陆的近期移民对海南岛人群有着较大贡献。这一研究成果公布在国际开源刊物《生物医学中心­­—进化生物学》（BMC Evolutionary Biology）上。

领导这一研究的是昆明动物研究所张亚平院士，其早年毕业于复旦大学生物系，1991年获中国科学院昆明动物研究所博士学位，在他37岁的时候成为了中国科学院院士。主要的研究包括在国内较早地、系统地开展动物分子系统学的研究，深入研究灵长类、食肉类、兔形类和啮齿类的进化，在国际上建立了较为全面的熊超科分子系统树等。

在距今约2万年前的末次盛冰期（the Last Glacial Maximum，LGM），伴随冰盖体积的增长，海平面下降。这种情况在LGM结束后的气候转暖中发生逆转，即冰盖消融，海平面上升。在大陆沿海以及海岛地区，海平面的升降造成了海陆变迁，这一过程很可能对这些地区内史前人类的迁徙活动产生重要的影响。在东亚地区，海南岛与大陆的连接与分离就是LGM以来的海陆变迁过程的例证之一。

为了探讨这次事件是否在当今海南岛人群的遗传结构中留有相关印记，张亚平院士指导的研究生彭旻晟，贺军栋和刘海昕对来自3个群体的共计285份黎族样本的线粒体DNA（mtDNA）遗传多样性进行了分析。结合之前发表的数据，研究结果显示海南岛人群与广西人群的遗传关系较为密切；来自大陆的近期移民对海南岛人群有着较大贡献。

更为细致的研究发现，mtDNA单倍型类群M12，M7e和M7c1*是揭示人类早期移居海南岛的候选标记；而基于mtDNA全序列测定的系统地理学分析表明，早期移民发生在大约距今7千至2万7千年前。这个时间范围内，海南岛与大陆处于连接状态，因此提供了人类移居海南岛的有利条件。同时，近期在海南岛的考古学工作中发现的一些旧石器遗迹，时间推测在晚更新世，也对该研究结果提供了支持。

原文摘要：

Tracing the legacy of the early Hainan Islanders - a perspective from mitochondrial DNA

Background
Hainan Island is located around the conjunction of East Asia and Southeast Asia, and during the Last Glacial Maximum (LGM) was connected with the mainland. This provided an opportunity for the colonization of Hainan Island by modern human in the Upper Pleistocene. Whether the ancient dispersal left any footprints in the contemporary gene pool of Hainan islanders is in a hot debate.

Results
We collected samples from 285 Li individuals and analyzed mitochondrial DNA (mtDNA) variations of hypervariable sequence I and II (HVS-I and II), as well as partial coding regions. By incorporating previously reported data, the phylogeny of Hainan islanders was reconstructed. We found that Hainan islanders showed close relationship with the populations in mainland southern China, especially from Guangxi. Haplotype sharing analyses suggested that the recent gene flow from the mainland might play important roles in shaping the maternal pool of Hainan islanders. More importantly, haplogroups M12, M7e, and M7c1* might represent the genetic relics of the ancient population that populated this region; and 14 representative complete mtDNA genomes were further sequenced.

Conclusions
The detailed phylogeographic analyses of haplogroups M12, M7e, and M7c1* indicated that the early peopling of Hainan Island by modern human could be traced back to the early Holocene and/or even the late Upper Pleistocene, around 7 - 27 kya. These results correspond to both Y-chromosome and archaeological studies.

作者简介：

张亚平

院士，中共党员，理学博士，研究员，博士生导师。1991年在中科院昆明动物研究所获博士学位，1992－1995年初在美国圣地亚哥动物协会做博士后研究，1995年回国任研究员，现任中国科学院昆明动物研究所所长，中国遗传学会动物遗传专业委员会主任；《Cell Research》、《自然科学进展》、《遗传学报》、《科学通报》、《动物学报》、《生物多样性》、《动物学研究》等刊物编委。

他的研究小组主要从事进化基因组和基因组多样性研究,建立了广泛稳定的国际合作关系。他和合作者对哺乳动物重要类群的演化开展了系统深入的研究，澄清了一些类群系统与演化中的一些重要问题；在建立了东亚人群mtDNA单倍型类群的系统发育关系及基础上，探讨了东亚特别是中华民族的源流和人群的迁移与分化，提出了一些新观点；在我国系统研究了一些濒危动物和主要家养动物的遗传多样性；发现我国南方及周边地区是家养动物驯化的重要区域，证明遗传多样性的贫乏与物种濒危之间没有必然的对应关系；在脊椎动物中首次证明了微进化时间范围DNA进化速度有显著差异的现象，说明使用分子钟时应特别谨慎；深入开展了基因的起源进化和生物适应进化机制的研究，揭示了食物适应的一些遗传机制。1995年回国以来，在《Nature》、《Science》、《PNAS》、《Nature Genetics》、《American Journal of Human Genetics》等国际著名SCI刊物发表了一批论文，他们的论文已被引用约800次。因为在分子进化与遗传多样性方面的重要贡献，2002年荣获在美国颁发的国际大奖"Biodiversity Leadership Awards"，成为第一位获此殊荣的亚洲学者。他还先后获得过中国青年科学家奖、中国青年科技奖等奖励。 2001年入选国家创新研究群体。他与美国、日本等国的多个实验室有长期的合作关系，并联合培养研究生。已招收培养了一批博士和硕士研究生。

目前主持在研若干项国家和省部级项目，包括国家自然科学基金委创新研究小组项目"分子进化与进化基因组" （３６０万），中国科学院重要方向研究项目"动物的种群遗传及其与生态适应的关系" （３００万）等重大项目。