中国共有多少台高通量测序仪?

【字体: 时间:2011年05月30日 来源:生物通

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  生物通报道,近日,英国两名学者(James Hadfield和Nick Loman)绘制了高通量测序仪在全世界的分布图。根据他们的统计,目前全世界总共购买了1599台高通量测序仪(包括第二代和第三代),分布在527个研究中心,平均每个中心拥有3.0台测序仪。中国共有199台高通量测序仪,分布在8个机构。

  

生物通报道,近日,英国两名学者(James Hadfield和Nick Loman)绘制了高通量测序仪在全世界的分布图。

根据他们的统计,目前全世界总共购买了1599台高通量测序仪(包括第二代和第三代),分布在527个研究中心,平均每个中心拥有3.0台测序仪。

若按照国家来统计,毫无疑问美国是最多的,拥有702台,遥遥领先于其他国家,其次便是中国,拥有199台,英国以132台位列第三。之后是德国、加拿大、澳大利亚、西班牙、韩国、法国、日本。让人意想不到的是,台湾也拥有22台高通量测序仪,超过香港的13台。

与美国的分布广泛不同,中国的高通量测序仪主要集中在三个地区:深圳、北京和江浙沪地区。深圳华大基因不愧为全世界规模最大的基因组学研究中心,拥有166台高通量测序仪,占全国80%以上,也是全世界拥有最多高通量测序仪的基因组中心,领先于美国哈佛-麻省的Broad研究院(114台)。其中,Illumina HiSeq 137台,SOLiD 27台,Roche/454 1台,Ion Torrent 1台。

在北京地区,北京基因组研究所拥有15台高通量测序仪,分别为:9台SOLiD 3/4、5台Illumina GA2和1台454;而北京贝瑞和康生物技术有限公司也拥有2台测序仪,分别为Illumina的GA2和HiSeq,这家公司提供测序和产前诊断业务。

在江浙沪地区,上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心拥有4台SOLiD 4/5500、2台Illumina GA2和1台454;而康成生物拥有1台Illumina GA2;浙江大学也拥有1台Illumina GA2;苏州众信生物技术有限公司拥有2台SOLiD、1台Illumina HiSeq和1台Illumina GA2;苏州生物医药创新中心也拥有Illumina的测序仪。

就各测序平台的销售情况而言,Illumina无疑是最大的赢家,总共售出了627台Genome Analyzer 2和367台HiSeq 2000。ABI售出296台SOLiD,而罗氏454售出262台测序仪。这些数据也与Frost & Sullivan的统计结果基本相符,根据Frost & Sullivan对2010年NGS市场份额的统计,Illumina占69%,Life Tech占16%,Roche占15%。

当然,这些数据也不是非常准确,仅供大家参考。据生物通所知,中山大学也有一台454的测序仪,而北京毅新兴业公司也新引进了6台Illumina GAIIx测序仪和2台Polonator测序仪。还有网友提到,同济大学也有一台GA2和一台454。

随着454测序仪的读长不断提高,Illumina和ABI相继推出个人化测序仪,而第三代测序仪PacBio RS在国内也即将开售,高通量测序仪的竞争将愈加激烈。未来形势将如何发展,让我们拭目以待。(生物通 余亮)

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