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J Virol:中国学者解析新病毒
【字体: 大 中 小 】 时间:2012年10月17日 来源:生物通
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来自中国疾控中心(CDC)传染病预防控制所,浙江省温州市CDC的研究人员报道称,我国社鼠所携带的汉他病毒(Hantavirus)不属于汉他型病毒,而是一个独立新种,并将其命名为“大别山病毒”,这一研究成果揭示了动物源性病原体在宿主动物间的跨种间传播与病毒进化的规律,相关研究公布在Journal of Virology杂志上。
生物通报道:来自中国疾控中心(CDC)传染病预防控制所,浙江省温州市CDC的研究人员报道称,我国社鼠所携带的汉他病毒(Hantavirus)不属于汉他型病毒,而是一个独立新种,并将其命名为“大别山病毒”,这一研究成果揭示了动物源性病原体在宿主动物间的跨种间传播与病毒进化的规律,相关研究公布在Journal of Virology杂志上。
领导这一研究的是CDC传染病预防控制所张永振研究员,张永振研究组致力于汉他病毒疾病研究,曾发现多种新亚型汉他病毒。
汉他病毒Hantavirus为负链单股RNA病毒,呈圆形或卵圆形,直径约80-115 (95) nm,也有呈细长型,核外包围一层含有脂质的套膜(envelope),套膜表面有糖蛋白(G1,G2)突起,对热不稳定,很容易用消毒用酒精使之不活化。1993年在美国西南部发生一种致死率极高(50%以上)之急性肺疾病,称为汉他病毒肺症候群,是感染一种以鹿鼠 (Peromyscus maniculatus)为天然宿主的新型汉他病毒造成。
2000年,研究人员在安徽大别山地区社鼠Niviventer rats中分离到一株汉坦病毒,与引起重型肾综合征出血热的汉他型病毒有较高亲缘关系,被认为是汉他型病毒的新亚型;其后在云南省社鼠中也检测到该病毒。
然而在这篇文章中,研究人员通过66份社鼠标本检测,系统分析病毒,发现这些病毒均与汉他型病毒在氨基酸序列上存在7%以上的差异,符合国际病毒分类委员会制定的布尼亚病毒科病毒新种的分类标准,可以认定不属于汉他型病毒,应为汉他病毒属的一个独立新种,并将其命名为“大别山病毒”。
而且研究人员还进行了基因比对和遗传进化分析,发现自然界中不同型汉他病毒间可以发生基因重排,这10个汉他病毒在种的形成过程中至少发生了9次跨种间传播事件。病毒经跨种间传播感染新宿主后,在新宿主的遗传环境中经遗传漂变和适应性进化,形成了现在不同种类鼠所携带的各汉他病毒种及其遗传多样性。
这是张永振研究组今年发表的多个新病毒中的一个,今年早期他们在浙江、湖南及贵州山区,发现了分布有地理聚集特征明显的3个新亚型汉他病毒,并发现目前已知所有汉他病毒至少可分为4个基因亚型,每个亚型间基因组的核苷酸差异在10%以上,具有遗传多样性;中国绝大多数汉他病毒及世界其他所有国家已发现的汉他病毒均为I亚型;褐家鼠的迁徙导致了当今汉他病毒的世界分布。
这些研究都指出动物源性疾病与社会生态环境紧密关系,全球化等因素带来的社会生态环境改变,将会导致动物源性疾病的播散。
(生物通:万纹)
原文摘要:
Cross-species transmission in the speciation of the currently known murinae-associated hantaviruses
To gain more insight into the phylogeny of Dabieshan virus (DBSV), carried by Niviventer confucianus and other Murinae-associated hantaviruses, genome sequences of novel variants of DBSV were recovered from Niviventer rats trapped in the mountainous areas of Wenzhou, China. Genetic analyses show that all known genetic variants of DBSV, including the ones identified in this study, are distinct from other Murinae-associated hantaviruses. DBSV variants show geographic clustering and high intraspecies diversity. The data suggest that DBSV is a distinct species in the genus Hantavirus. Interestingly, DBSV shows the highest sequence identity to Hantaan virus (HTNV), with a >7% difference in the sequences of the N, GPC, and L proteins, while N. confucianus is more closely related to Rattus norvegicus (the host of Seoul virus [SEOV]) than to Apodemus agrarius (the host of HTNV and Saaremaa virus [SAAV]). Further genetic analyses of all known Murinae-associated hantaviruses (both established and tentative species) show that many of them, including DBSV, may have originated from host switching. The estimation of evolutionary rates and divergence time supports the role of cross-species transmission in the evolution of Murinae-associated hantaviruses. The detection of positive selection suggests that genetic drift may contribute to the speciation of Murinae-associated hantaviruses and that adaptation has a role as well.