稀有变异或与前列腺癌的早期诊断相关

　　

生物通报道 由冰岛deCODE genetics公司领导的国际研究小组通过全基因组测序，鉴定出欧洲群体中8号染色体上一个与前列腺癌相关的稀有变异。该成果在线发表于10月28日的《Nature Genetics》上。

在西方国家，前列腺癌是男性中最常见的癌症。之前的GWAS研究发现了几十个与前列腺癌相关的常见变异，然而，每个SNP的风险水平都往往是中等或低。于是，在这项研究中，研究人员致力于发现那些在人群中发生频率较低的前列腺癌相关变异，因为他们怀疑，稀有变异可能对疾病风险有着更为显著的影响。

为了探索这种可能性，研究小组利用了71,700多名冰岛人的基因分型数据。同时，他们还对1,795名冰岛人开展了全基因组测序，覆盖度至少为10倍。这些信息帮助研究小组在发现阶段追踪了数百个前列腺癌相关的SNP，这主要集中在5,141名患有前列腺癌的冰岛男性以及54,444名未受影响的男性对照。

变异主要分布在8号和17号染色体，而过去的研究也表明它们与前列腺癌有关。这促使研究人员进一步分析与疾病风险独立相关的新变异。研究小组将范围缩小到8号染色体上的一对SNP，之后在五组前列腺癌病例和对照中检测了这两个变异。这五组研究对象都有着欧洲血统，来自欧洲和美国。结果表明，两个变异都与前列腺癌风险显著相关。

之后，研究人员又对498名来自香港的前列腺癌患者以及467名来自芝加哥的非洲裔美国人对照进行了分析，发现这两个SNP在非欧洲血统的个体中不呈现多态性。

在他们的后续分析中，研究人员集中在其中一个8号染色体变异（rs188140481）上。这个SNP比之前发现的常见变异更靠近染色体的端粒一端。此外，冰岛人群以及其他欧洲血统人群的前列腺癌病例和对照的数据暗示，此SNP与前列腺癌的较早期诊断相关。rs188140481的携带者比未携带者早一年多诊断出前列腺癌。这说明比之前发现的常见变异相比，它与前列腺癌有着更密切的关系。

研究人员表示，他们还需要更多研究来确定这个新变异的功能作用。但到目前为止的结果表明，与之前GWAS研究发现的常见变异相比，它与欧洲人群中前列腺癌的更高风险相关。（生物通 薄荷）

原文检索

A study based on whole-genome sequencing yields a rare variant at 8q24 associated with prostate cancer

Nature Genetics (2012) doi:10.1038/ng.2437