Science：诺奖得主助阵，大型Biobank发布早期成果

　　

生物通报道：目前美国最大规模的biobank在本周美国人类遗传学学会ASHG的年会上发布了他们的初步成果。研究人员对100,000名加州人的遗传学数据和医疗信息进行了研究，揭示了遗传学突变、端粒与疾病之间的紧密联系，端粒是染色体末端保护性的DNA序列。大型保健机构Kaiser Permanente（KP）是该biobank的建立者，他们称这些成果还只是个开端。

这一项目旨在收集大量人群的医疗信息和DNA数据，以便分析疾病、生活方式、遗传学特征与基因之间的关联。与此类似的还有，冰岛著名生物公司deCODE genetics十多年前率先建立的biobank，现拥有140,000冰岛人的数据。而目前全球最大的Biobank在英国，目前已登记500,000人，不过还未进行DNA检测。

在NIH耗资两千五百万美元为期两年的资助下，KP与加州大学合作在公司医疗系统中对100,000加州人的基因组进行了筛查。研究人员还检测了参与者的端粒长度，端粒随着细胞的每一次分裂逐渐缩短，达到一定程度就会使细胞进入衰老阶段。上述参与者平均年龄63岁，其中81%是白种人其他还包括亚洲人、拉丁美洲人和非洲裔美国人，这些参与者都填写了健康调查表。研究人员将这些参与者的遗传信息与其病例中的临床数据结合起来，证实SNP遗传学标志和胆固醇水平与心脏病风险关系密切。

研究揭示了可能影响胆固醇水平的新SNP，研究人员还指出，与此前的SNP研究相比该研究中已知胆固醇相关SNP与疾病的关系更紧密。这是该biobank规模大临床信息质量高所带来的优势，其他小规模且分散的研究无法与之媲美。

2009年因端粒研究荣获诺贝尔生理学/医学奖的伊丽莎白·布莱克本（Elizabeth Blackburn）为KP的这项研究提供了端粒检测。研究团队证实老年人、抽烟者和酗酒者的端粒更短，但并未发现之前有些研究报道的其他关联。例如他们并未发现常运动的人端粒会更长，研究也未显示端粒短与死亡风险有关，而这些都是一些小规模研究得出的结论。短端粒是否会直接导致死亡，抑或是通过影响其他因素导致死亡，这一问题一直存在争议，但本研究未能解决这一问题。

KP biobank医疗记录中的匿名数据（从药物使用到脑部影像）也对其他研究人员开放，他们希望这些数据能够得到广泛应用。这些数据将会发布在NIH分享SNP数据的数据库dbGaP中，研究者们也可以申请与KP团队进行合作。至于如何应用这样大量的数据完全由研究者们自行决定。例如，可以结合空气污染数据来分析疾病与污染的关系。该biobank的规模还在持续扩大，总共有200,000名KP成员捐赠了生物样本，并且已有430,000人表示愿意参与这一项目。

Johns Hopkins大学的人类遗传学家Aravinda Chakravarti正在考虑与KP合作，不过他也表示了自己的担忧，在ASHG会议上许多人都在关注用测序等方法揭示疾病基因。他说，“我们这一领域的问题在于，总在不停的列出疾病相关基因的清单”，他更倾向于研究这些基因的功能及其发病机理。

（生物通编辑：叶予）

生物通推荐原文摘要：

Largest U.S. Genetic Biobank Reveals Early Findings

Researchers who have assembled a trove of genetic and medical data on 100,000 northern Californians unveiled their initial findings here this week at the annual meeting of the American Society of Human Genetics (ASHG). The effort, which may be the largest such "biobank" in the United States, has already yielded an intriguing connection between mortality and telomeres, the protective DNA sequences that cap chromosome ends, and found new links between genetic variants and disease traits. And that's just the beginning, say the biobank's curators at Kaiser Permanente (KP), the giant health care organization.