
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
Illumina推出人类外显子组芯片[新品推荐]
【字体: 大 中 小 】 时间:2012年04月28日 来源:生物通
编辑推荐:
Illumina近日推出了用于人类外显子组研究的Human Exome BeadChip芯片。Human Exome BeadChip芯片前所未有地覆盖了推定的功能性外显子变异,这些变异精选自12,000多个个体的外显子组和全基因组序列。
以芯片起家的Illumina虽然近年来致力于新一代测序仪的研发,但始终没有离开老本行。BeadChip芯片的范围也在不断壮大。最近,Illumina又推出了用于人类外显子组研究的Human Exome BeadChip芯片。
Human Exome BeadChip芯片前所未有地覆盖了推定的功能性外显子变异,这些变异精选自12,000多个个体的外显子组和全基因组序列。外显子内容包含了> 240,000个标志物,它们代表了不同群体—包括欧洲、非洲、中国和西班牙个体—以及多种常见病,如II型糖尿病、癌症、代谢及精神疾病。
目前有四种单独的芯片可供选择,以支持各种旨在发现功能相关的疾病关联的研究类型。此外,研究人员还可在Exome BeadChip芯片上添加自定义的标志物,以便以更高密度靶定基因组的特定区域,聚焦目标人群,或掺入精选的疾病相关变异。
Infinium® HumanExome BeadChip芯片
Infinium HumanExome BeadChip芯片以12个样品的阵列形式提供了外显子内容。它重点覆盖外显子区域,但不覆盖编码区以外的区域。研究人员可利用此芯片从过去基因分型过的队列中获得新见解,或开展新研究,致力于发现功能相关的关联。
HumanOmniExpressExome BeadChip芯片
除了> 240,000个外显子标志物,HumanOmniExpressExome BeadChip芯片还特有> 700,000个基因组范围的标志物,它们覆盖了最小等位基因频率> 5%的变异。研究人员最多还可以添加30,000个自定义的标志物。
HumanOmni2.5Exome BeadChip芯片
8个样品的HumanOmni2.5Exome BeadChip芯片综合了来自HapMap和千人基因组计划的250万个SNP标签(> 2.5% MAF),以及> 240,000个外显子标志物。
HumanOmni5Exome BeadChip芯片
4个样品的HumanOmni5Exome BeadChip芯片特有> 430万个SNP标签,以及> 240,000个外显子标志物。此芯片广泛地覆盖了人类基因组内常见和稀有变异(> 1% MAF),并前所未有地覆盖了基因内的编码变异,为获得潜在疾病通路的新见解提供了最大的可能性。研究人员最多还可添加200,000个自定义的标志物。
如今,研究人员可利用HumanExome BeadChip芯片从过去基因分型的队列中获得新见解。而HumanOmniExpressExome、HumanOmni2.5Exome和HumanOmni5Exome BeadChip芯片可最大程度地覆盖外显子,适合新的基因分型研究。