Nature报道华大基因收购美国测序公司

【字体: 时间:2012年09月27日 来源:生物通

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  9月17日,华大基因宣布同意合并处于苦苦挣扎中的Complete Genomics公司,将花费1.176亿美元购买它的股份。这一援救不仅受到了该公司董事局的欢迎,也将会获得担心选择减少成为基因组学一个问题的那些人的欢迎。

  

生物通报道  自2009年开始基因组测序以来,总部在加州山景城(Mountain View)的DNA服务公司Complete Genomics因其技术获得了良好的口碑,但在商业方面取得的成功却微乎其微。研究人员对其以最小错误生成完整人类基因组读数的能力非常看重,然而在2011年该公司高达7230万美元的亏损不禁让研究人员担心它的未来。现在中国的测序机构深圳华大基因(BGI)抛给了Complete Genomics一条救命索。

9月17日,华大基因宣布同意合并这家正处于苦苦挣扎中的公司,将花费1.176亿美元购买它的股份。这一援救不仅受到了该公司董事局的欢迎,也将会获得担心选择减少成为基因组学一个问题的那些人的欢迎。

加州斯坦福基因组学和个体化医疗中心主任Michael Snyder说:“如果现在Complete Genomics倒闭,Illumina将垄断整个市场。”位于加州圣地亚哥的Illumina公司所制造的仪器导致了全球大部分的测序输出。Snyder说维持行业内的竞争将有助于保持住低廉的价格,促进技术改进。

像Complete Genomics一样,华大基因出售的是测试服务而非仪器或试剂,但它主要依赖Illumina制造的仪器。Complete Genomics拥有自己的设备和软件平台,专门用于测序全人类基因组。

虽然比较不断变化的平台并不简单,一份2011年针对Complete Genomics和Illumina技术获得的相同基因组读段(read)的分析表明尽管前者发现的DNA序列变异相对标准参考数量要少,却更加的精确。在7月,Complete Genomics描述的一项技术将测序基因组的错误率减少到了每千万一个碱基对,并减少了生成序列所需的DNA的量。该技术还可以区分来自父亲和母亲相同染色体版本的DNA片段。例如它能够揭示突变是发生在某个基因的一个或是两个拷贝,由此推断个体是否具有罹患某种疾病的风险或仅仅是携带者。

“这将改变全基因组注释和分析的游戏规则,”礼来(Eli Lilly)公司的遗传学家Thomas Barber说。华大基因的收购意味着研究人员将继续从这样的进展中受益。同一所有权下的两家公司将联合双方的优势。

芝加哥股权投资公司William Blair分析师Amanda Murphy说Complete Genomics的专门技术市场稳定地增长。目前为止大部分的人类测序侧重于外显子组,大约1.5%的基因组编码蛋白质。但近期的ENCODE计划和其他的研究正在揭示非蛋白质编码区域的功能。她说:“我认为世界正在走向全基因组测序。但对于Complete Genomics而言需求没有足够快到自身坚持下去。”

对于服务的需求也在增长。许多研究人员想要利用测序数据,但却不想投资在自己完成测序所需的技术和仪器上。甚至大型的学术测序中心通常拥有的测序项目也超越了能力。

Complete Genomics技术一个主要的缺陷是需要两到三个月生成一段序列,阻碍了医学应用。但这一平台有望得到加快。荷兰鹿特丹bioinformatics负责人Peter van der Spek担心在华大基因之下创新将停滞,尽管华大基因的发言人称Complete Genomics目前的工作人员将留在公司,开发也将继续。

贝勒医学院人类基因组测序中心主任Richard Gibbs说无论哪种方式,团队最好是有选择。“如果我们只有一种测试,一台机器和一种过程,事情将会发生,但却不会那么快。”

(生物通:何嫱)

生物通推荐原文摘要:

China buys US sequencing firm

Since it started sequencing genomes in 2009, the DNA services company Complete Genomics has garnered praise for its technology, but little commercial success. Researchers valued its ability to produce readouts of entire human genomes with minimal errors, but they feared for the future of the company, based in Mountain View, California, which lost US$72.3 million in 2011 alone. Now BGI, whose sequencing facility in Shenzhen, China, is the largest in the world, has tossed Complete Genomics a lifeline.

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