MiSeq测序仪获FDA采购应用并将全面升级[新品推荐]

日前，MiSeq测序仪可谓双喜临门，不仅获得美国食品药品监督管理局（FDA）的认同，更将全面强势升级。作为中国区第一家引进MiSeq的公司——上海派森诺生物科技有限公司，日前已实现MiSeq 测序仪硬件和软件升级，只待最新试剂盒的推出，即可实现全面升级。

日前，MiSeq测序仪可谓双喜临门，不仅获得美国食品药品监督管理局（FDA）的认同，更将全面强势升级。

Illumina 公司18日宣布，它获得了一份来自 FDA 的合同，为该机构提供MiSeq测序系统及试剂，以便开展食品安全相关的沙门氏菌和产志贺毒素大肠杆菌的全基因组分析进行病菌爆发的溯源。

FDA已有的几台MiSeq系统正在用于加强建设其现有资源和培训方面的能力，进一步展现全基因组测序技术在病原检测概念验证方面的优势。基于快速的运行时间、流程简单、高分辨率和准确性等方面的优势，MiSeq是筛查细菌病原体的理想选择，在鉴定亲缘关系相近的细菌分离株的能力上优势非常明显。近期，FDA希望在食品安全相关的沙门氏菌上获得数据，这对未来疫情的爆发的追踪溯源将具有非常重要的意义。

作为中国区第一家引进MiSeq的公司——上海派森诺生物科技有限公司，日前已实现MiSeq 测序仪硬件和软件升级，只待最新试剂盒的推出，即可实现全面升级。MiSeq系统升级后，测序通量将由原来的2G升至7G左右。升级将通过两个方面完成，一个是cluster密度的增大，升级后cluster密度将会增加至12-15million，而pair-end读取的reads数目将会增加至24-30million；另一方面是通过测序读长而提升通量，届时测序读长会达到2*250bp，同时测序速度也会有所提升。目前，Broad研究院已经利用现有试剂实现了单端测序300bp读长，Illumina内部测序更是完成了2*400bp的pair-end测序。而这些，都是保证在高质量数据结果的前提下完成的。

测序时间数据量比对

读长 (bp)	总时间		产量
	升级前	升级后	升级前	升级后
1 × 36	4 小时	3.2-3.5 小时	175-245 Mb	440-550 Mb
2 × 25	5 小时	4.6-5 小时	250-350 Mb	640-800 Mb
2 × 100	19小时	14-16 小时	1.0-1.4 Gb	2.5-3.1 Gb
2 × 150	27 小时	20.7-24 小时	1.5-2.0 Gb	3.7-4.6 Gb
2 × 250	—	>35 小时	—	6.0-7.0 Gb

读取量比对

运行类型	通过过滤的读取（百万）
	升级前	升级后
单端读取	5-7 M	12-15 M
末端配对读取	10-14 M	24-30 M

MiSeq系统利用TruSeq化学原理，Illumina所有测序平台所用的久经考验的可逆终止子边合成边测序技术。它内置了电脑显示屏及其操作界面、簇生成、测序仪、一年的数据存储以及数据分析软件。操作极简单，最终数据直接输出，特别适合医学、农业等领域的研究， 实现高效的新一代测序应用，如微生物de novo测序、定向重测序、简化基因组测序、小RNA测序以及更多项目应用。

派森诺生物自率先引进中国首台Illumina MiSeq个人测序仪起，陆续引进亚太区第一台罗氏升级版测序平台 Roche 454 GS FLX+ system 等一系列测序平台后，一直走在第二代高通量测序领域的前列， 已合作完成多项重大科研项目。如骆驼等动物的基因组测序、乳酸菌等微生物基因组测序、人肠道宏基因组测序、 斑马鱼转录组测序、鸡的小RNA测序以及多种疾病相关的人外显子组测序等项目。同时，派森诺生物以“解析序列，诠释生命”为使命，不断创新，开发了一系列包括简化基因组测序、Chip-Seq等技术。公司始终以“满足客户的个性化需求”为宗旨，为广大合作伙伴定制了一套套个性化的测序方案，受到合作伙伴的一致认同和好评，最终取得了圆满成功。

上海派森诺生物科技有限公司目前已有合作伙伴横跨农业、医学等多个领域，包括中国科学院、中国农业科学院、上海交通大学、华东理工大学、南京大学、内蒙古农业大学、华中农业大学、华南农业大学、山东农业大学、上海海洋大学、温州医学院、瑞金医院、新华医院等。相信在未来派森诺生物能携手更多的科研工作者，共同推进生命科学的发展。