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NGS调查:你最想买哪款测序仪?
【字体: 大 中 小 】 时间:2013年11月18日 来源:生物通
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为了更好地了解新一代测序技术在国内的应用情况,以便为您提供更全面、更有用的信息,生物通在金秋十月开展了新一代测序技术有奖调查。在短短两周的时间内,我们收到了254份有效问卷。在此非常感谢读者们的积极参与,抽奖结果已于11月15日在生物通网站上公布。
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在有意购买新一代测序仪的参与者中,半数以上来自大专院校(包括中科院多个研究所),说明NGS测序仪在科研中的应用会继续升温。多家生物技术公司/制药公司也表现出了浓厚的兴趣,有意购买。随着NGS的临床应用不断扩展,多家医院也有意争饮“头啖汤”。

在这些参与者中,希望购买Illumina测序仪的人数接近一半,其中HiSeq系列为35%,MiSeq为14%。希望购买Life Technologies测序仪的人数超过三成,其中Ion PGM和Ion Proton接近,分别为18%和15%。另有6%的参与者有意购买Pacific Biosciences的单分子测序仪PacBio RS。此外,还有12%的参与者希望购买罗氏454的测序仪。

具体来看,对于各大高校和研究所,客户似乎对高通量测序仪格外青睐,如Illumina的HiSeq系列,有意购买比例达40%,高于平均水平。而对于医院/临床实验室,客户则更喜欢台式测序仪,包括Ion Proton、Ion PGM、MiSeq和GS Junior。制药公司研发中心或生物技术公司的用户则对Ion Torrent测序平台表现出了浓厚的兴趣,有意购买比例达43%。
在选购测序仪时,价格当然是重要的考虑因素,但若不考虑价格呢,你最看重什么性能?76%的参与者认为准确性很重要,一半的参与者认为通量很重要,而30%的人看重读长。至于运行时间及其他功能(碱基修饰),大部分人认为这不是主要考虑因素。

至于测序应用,30%的参与者表示将使用NGS测序仪开展转录组测序(RNA-seq)。其他颇受欢迎的应用包括全基因组测序(15%)、扩增子测序(14%)和甲基化研究(12%)。
虽说新一代测序技术已经有了很大的改善,但不少客户仍在观望。是什么让他们难下决心?38%的参与者表示,这是因为数据分析复杂。而仪器成本高、分析和维护成本高,也像一道门槛,拦住了部分客户。只有8%的参与者认为,测序仪的性能参数有待提高。

目前,个性化医疗是个很热的概念。新一代测序有望带来疾病的重要线索,让医生挑选更为精准的药物。对于新一代测序的临床前景,81%的参与者都表示看好。那么,就让我们拭目以待吧。(生物通 薄荷)
