Life Tech宣布测序仪性能提升[新品推荐]

生物通报道  Life Technologies公司近日宣布了Ion PGM™ 测序仪的性能提升。据该公司介绍，Ion PGM™ 如今有着“最简单快速的流程，最低的成本，以及最高的灵敏度，适合多个基础和临床研究应用”。

此次性能提升源自多个因素，前期的样品制备自动化，新的Ion PGM™ 半导体芯片，以及软件的改进。此外，重新设计的Ion PGM™ 测序仪在价格上也低了30%，这要归功于电子产品制造的规模经济。

Ion Torrent的营销副总裁Maneesh Jain表示：“Ion PGM™和Ion AmpliSeq™ 技术改变了基因测序，让它更快速、更简单、更普及，这也让我们成为市场上一流的台式测序仪。”

Ion AmpliSeq™ 技术让研究人员能够在单管中扩增多达6,000个目标，仅需10 ng起始样品和3.5小时。在过去18个月内，超过1,500名研究人员已设计出5,000多个Ion AmpliSeq™ 基因组合，说明这一技术被广泛采用。

过去，研究人员在测序基因组合时，总是苦于无法找到样品中存在的所有突变。Ion AmpliSeq™ 技术结合Torrent Suit v3.6软件则为多个组合带来了近乎100%的灵敏度，让研究人员能够发现他们感兴趣的变异。此外，新的Ion Reporter 1.6软件研究人员能够快速注释和过滤变异。

最近，两个研究小组利用Ion AmpliSeq™ Community panel对BRCA1和BRCA2基因进行测序，说明了Ion PGM™ 技术的准确性和灵敏度。这两个基因与遗传性乳腺癌和卵巢癌高度相关，近日因安吉丽娜•茱莉的声明而受到广泛关注。然而，这两个基因很难测序，因为许多突变分散在整个基因中，包括许多截短突变和均聚物区域。

葡萄牙波尔图大学分子病理学和免疫学研究所的Jose Carlos Machado博士谈道：“我们将各种遗传检测移到了Ion PGM™ 系统。分析结果表明，特异性达99%，分析灵敏度也达99%。而手工操作时间的缩短也让实验室技术人员能够开展其他工作。”

Machado博士正与荷兰内梅亨大学医学中心的Marcel Nelen等研究人员合作。Nelen博士表示：“我们用Ion AmpliSeq™ BRCA1 & BRCA 2 Community Panel和Ion PGM™对65个困难样品测序，没有错过任何突变。我们的数据显示出Sanger测序的灵敏度，而均聚物区域也得以解决。”

据介绍，第二代的Ion 314芯片通量从原先的10 Mb增加到100 Mb，而价格仍为99美元。Ion 316芯片通量将从原先的100 Mb增加到1 Gb，而Ion 318芯片将产生2 Gb的数据，是之前的2倍。（生物通 余亮）

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Ion PGM™ 系统的性能参数

		Ion 314™ 芯片v2	Ion 316™ 芯片v2	Ion 318™ 芯片v2
产量	200个碱基 400个碱基	30-50 Mb 60-100 Mb	300-600 Mb 600 Mb – 1 Gb	600 Mb – 1 Gb 1.2-2 Gb
读取		40-55万个	200-300万个	400-550万个
运行时间	200个碱基 400个碱基	2.3小时 3.7小时	3.0小时 4.9小时	4.4小时 7.3小时
研究领域		癌症研究 遗传病研究 微生物学	干细胞研究 农业 表观基因组学	宏基因组学 法医学 古老DNA基因组学