南方医科大学最新文章：差异表达基因解析癌症转移

　　

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生物通报道：大肠癌是消化道常见的恶性肿瘤之一，转移是造成大肠癌患者死亡的首要原因, 因此明确大肠癌早期转移相关分子事件中的关键基因, 对大肠癌的诊断与治疗均有重要意义。来自南方医科大学基础医学院的两位研究人员通过大肠癌基因表达谱数据筛选差异表达基因，由此分析差异表达基因在大肠癌早期转移中所起到的关键作用，找到了在大肠癌转移分子机制中可能起着重要作用的基因。

大肠癌是消化道主要的恶性肿瘤之一, 其恶性程度高, 早期即可通过淋巴道转移, 对人体危害极大。在转移早期肿瘤细胞会出现形态变化使之能够变形、游走, 这是肿瘤转移的关键步骤, 因此明确肿瘤的早期转移相关分子机制, 筛选早期转移分子事件中的关键基因, 是抑制肿瘤转移、研发靶向治疗药物的关键一步。

在这篇文章中，研究人员主要通过对表达谱数据中早期转移的大肠癌数据与正常大肠数据的差异表达基因进行筛选, 并对筛选出的基因进行统计学及实验验证并进行生物信息学分析, 通过表达谱数据分析差异表达基因与患者生存期、 肿瘤组织的分化程度及肿瘤分期之间的关系, 并通过差异表达基因在不同物种间平均进化距离的大小, 明确这些基因的保守程度, 进一步分析差异表达基因相互作用蛋白及相互作用蛋白所组成的网络模块, 明确差异表达基因在大肠癌转移中所起的重要作用。

研究人员最终筛选出了与大肠癌早期转移相关差异表达基因共16个, 其中表达上调的9个基因分别为 VSNL1, PSAT1, KIAA1199, ABHD7, MMP7, JUB, CLDN1, KRT23, FOXQ1. 表达下调的 7个基因分别为 SFRP1, SLC4A4, CHGA, GCG, GUCA2B, CLDN8, CD177。

经过分析, 与组织分化程度相关的基因有PSAT1和JUB, 与肿瘤分期相关的基因有VSNL1和MMP7。而且VSNL1, PSAT1, CLDN1, SLC4A4, GCG基因在进化过程中较为保守。

由此研究人员指出, 上调的 9个差异表达基因及下调的 7 个差异表达基因在大肠癌转移分子机制中可能起着重要作用, 因其在大肠癌中的特异度较高, 有望能够成为联合诊断的分子标签。

这项研究通过对筛选的大肠癌早期转移相关的关键基因的分析, 明确了关键基因在大肠癌转移中所起的重要作用, 并进一步验证了差异表达基因在大肠癌中的特异性, 这些关键基因对提供大肠癌转移相关药物治疗靶点及大肠癌早期转移分子诊断有重要的指导意义。

原文检索：

齐鲁, 丁彦青. 基于差异表达基因探索大肠癌早期转移相关分子机制. 中国科学: 生命科学, 2013, 43: 579–588
Qi L, Ding Y Q. Exploration of the mechanism of colorectal cancer early metastasis based on differential expression gene. SCIENTIA SINICA Vitae, 2013, 43: 579–588, doi: 10.1360/052013-45