
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
Life Tech推出CNV分析的端对端测序方案[新品推荐]
【字体: 大 中 小 】 时间:2013年09月10日 来源:生物通
编辑推荐:
拷贝数变异(Copy number variation,CNV)是近年来人类基因组学和遗传学领域的研究热点。为顺应这一研究趋势,Life Technologies公司近日宣布推出外显子水平拷贝数分析的测序方案。这一方案融合了Ion Reporter™ CNV数据分析流程、Ion AmpliSeq™外显子组试剂盒和Ion Proton®系统。
拷贝数变异(Copy number variation,CNV)是近年来人类基因组学和遗传学领域的研究热点。为顺应这一研究趋势,Life Technologies公司近日宣布推出外显子水平拷贝数分析的测序方案。这一方案融合了Ion Reporter™ CNV数据分析流程、Ion AmpliSeq™外显子组试剂盒和Ion Proton®系统。
作为大规模基因组事件(如缺失、重复、倒位和易位)的后果,遗传性和de novo CNV与多种疾病有着密切的关联,包括癌症、自闭症和精神分裂症。目前,CNV分析主要是通过芯片和荧光原位杂交(FISH)来开展,但有些动态范围差,分辨率不高。
Life Tech的Ion AmpliSeq™外显子组试剂盒和Ion Reporter™软件提供了一个完整的解决方案,可检测SNP、插入缺失和高分辨率的拷贝数变异。
Ion AmpliSeq™外显子组试剂盒带来了简单快速的样品制备流程,其手工操作时间不到60分钟。外显子组富集和文库制备可在6小时内完成,且仅需50 ng起始DNA。与Ion Proton™系统配合使用,Ion AmpliSeq™外显子组试剂盒让研究人员能够实现经济的外显子组测序,而不必为了降低成本去集合一批样品。
Ion Reporter™ 软件的CNV数据分析流程则大大简化了CNV、SNP和插入缺失的鉴定和解释,让几乎任何人都能快速了解外显子组数据的意义,且灵敏度与芯片数据相当。您只需在预定义的Ion Reporter™ 软件CNV数据分析流程中选择,运行样品,即可获得一份突变列表以及来自各大公共数据库的相关注释,这一切在一天之内即可完成。
Ion Proton™系统于一年前推出,带来了快速、经济实惠的基因组测序。利用Ion PI™ 芯片,系统可在2-4小时内对外显子组和转录组进行测序。最初,仪器将带来6-8x107个过滤读取以及高达10 Gb的产量,之后还会逐步提升。读长为100-200 bp,一致准确性与Ion PGM™ 测序仪相当。而预计不久后上市的Ion PII™芯片将会在几小时内对人类基因组测序,费用也仅需1000美元。(生物通 薄荷)