mBio：到底有多少种哺乳动物病毒

近年来，不断有陌生的病毒从其他哺乳动物跳跃到人体中来，如SARS和MERS冠状病毒，而且速度越来越快。近期一组研究人员利用了一种新方法来分析新出现的疾病，他们希望能在病毒扩散到人体之前，给世界上的每一种哺乳动物病毒分门别类。

　　

生物通报道：近年来，不断有陌生的病毒从其他哺乳动物跳跃到人体中来，如SARS和MERS冠状病毒，而且速度越来越快。每一种新出现的病毒都迫使研究人员加紧研究，试图确定这些新品种，以防大流行疫情的威胁。

近期一组研究人员利用了一种新方法来分析新出现的疾病，他们希望能在病毒扩散到人体之前，给世界上的每一种哺乳动物病毒分门别类，“我们需要知道有多少种未知的病毒，”文章作者Peter Daszak表示，“这在之前没有人能够做到”。

Daszak研究组首先在一种称为印度飞狐（Indian flying fox）的单一物种中计算病毒的数量，然后通过分析，他们推断到所有5,500种哺乳动物中，预计这些动物有待研究的病毒至少有320,000种。虽然这样完成的图谱比较粗糙，但是能作为今后研究的一个起点。

“我们完成了拼图的边缘，现在我们正在努力更进一步”，文章的第一作者，哥伦比亚大学Simon Anthony说。

320,000这个数字比大多数病毒学家，包括Anthony和Daszak在内之前预计的要少。“我们认为病毒的总体多样性是无法估计的，”Anthony说。但是如果这一研究组的估计是正确的，那么“我们就能在未来二十年里，切实找到哺乳动物的大多数病毒。”并且除了一些禽流感病毒，如H7N9流感病毒，以及昆虫传播的病毒，像西尼罗河病毒，还有一些来自其他哺乳动物的新型疾病。

“这是一项非常及时，具有代表性的研究成果，”斯坦福大学病毒学家 Nathan Wolfe（未参与该项研究）说，“我认为我们正处在流行病发展的拐点。”

这项研究所采用的研究策略就是重复检测同一动物，寻找其体内生活的每一种病毒。之所以研究人员选择了飞狐，是因为这种动物携带了尼帕病毒和亨德拉病毒等多种病毒。

在过去五年中，由Jon Epstein和Ariful Islam领导的研究组收集了近1,900份飞狐的尿样，唾液和粪便样品。他们从每个样品中扩增和测序的病毒DNA，从中确定了55个不同的病毒，来自九大家族，其中50个是新发现的品种。

随着针对更多样本的实验，研究人员发现新病毒出现的速度在不断放缓。就此他们基于这一减速的发现率，利用统计技术来估算野生物种种群，研究人员计算出飞狐总共不会有超过58种病毒，这是已经发现的三倍数量。

如果每种哺乳动物都具有相似的病毒多样性，那么总共的数量将是320,000种不同的病毒。这个数字当然是非常初步的，Daszak指出，“它可能过低或过高，原因有很多，”例如，飞狐可能具有比一般的哺乳动物更多的病毒，而不同的哺乳动物也可能有许多共同的病毒等等。

（生物通：万纹）

原文检索：

S.J. Anthony et al., “A strategy to estimate unknown viral diversity in mammals,” mBio, 2013.