中外科学家Nature子刊发表癌症研究新成果

【字体: 时间:2014年05月20日 来源:生物通

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  来自范德堡大学医学院、中山大学等机构的研究人员,通过在东亚人群中展开大规模的遗传研究鉴别出了与大肠癌风险相关的6个新基因位点。相关论文发表在5月18日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。

  

生物通报道 来自范德堡大学医学院、中山大学等机构的研究人员,通过在东亚人群中展开大规模的遗传研究鉴别出了与大肠癌风险相关的6个新基因位点。相关论文发表在5月18日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。

领导这一研究的是华人科学家郑苇(Wei Zheng)教授,其现任范德堡大学Ingram癌症研究中心教授、分子流行病研究室主任,亦为美国NCI基金项目评审专家、美国国家卫生研究院、美国癌症研究协会等多个协会会员。其主要研究方向为肿瘤流行病与分子流行病学,是美国NIH“杰出学者”(Merit Award)获得者,是全美肿瘤流行病学界获得此荣誉的2名学者之一,具有极高的学术威望。

大肠癌是全世界最常见的癌症之一,在美国和其他发达国家发病率尤其高。遗传学在散发性和家族性(遗传性)形式的大肠癌中起重要作用(延伸阅读:中山大学Hepatology揭示癌症转移新机制 )。然而,当前只有6%的大肠癌病例可以通过罕见的遗传变异来进行解释,这些变异已知导致了大肠癌高风险(正如在家族性形式的大肠癌中所见到的)。

以往关于大肠癌遗传基础的研究已经确定了一些变异,然而大多数的研究都是在欧洲或高加索人群中完成。郑苇教授认为,基于种群之间存在着遗传结构的差异,在非欧洲种群中开展研究或许能够找到一些新的遗传风险因子。为此,郑苇及同事们于2009年在几个亚洲国家建立了“亚洲大肠癌协会”(Asia Colorectal Cancer Consortium)。该协会包括了中国、韩国和日本的群体。

在这篇文章中,采用一种称为“全基因组关联研究”(GWAS)的方法研究人员在东亚人群展开了相关研究。从来自14,963个大肠癌病例和31,945名对照的遗传数据中,研究人员确定了6个与大肠癌相关的新基因位点,它们分别位于10q22.3、10q25.2、11q12.2、12p13.31、17p13.3和19q13.2。

其中的两个位点定位在已确定在大肠癌发生中起作用的两个基因TCF7L2和TGFB1位置上。其他4个位点或是位于ZMIZ1(参与转录调控)、FEN1(参与维持基因组)、FADS1和FADS2(参与脂肪酸代谢)、CD9(参与癌细胞运动与转移),以及NXN(参与细胞生长和分化)基因中,或是靠近这些基因。

研究人员还找到了一些暗示性的证据表明,还有另外3个接近全基因组显著水平的大肠癌风险相关位点定位在8q24.11、10q21.1和10q24.2。此外,他们重复鉴别出了22个以往报道的与大肠癌相关的位点。

新研究提供了有关大肠癌遗传基础的一些新认识,揭示出了一些相关的新生物信号通路。对于大肠癌的诊断和治疗有可能具有重要的意义。

(生物通:何嫱)

作者简介:

郑苇

教授,来自Vanderbilt 大学,该大学位于美国田纳西州纳什维尔市,有“南方哈佛”之称,
在全美排名第17 位。郑教授现任该校医学院流行病学系主任,毕业于原上海医科大学,获得JohnsHopkins 大学流行病学专业博士学位,先后任职于NCI、Minnesota 大学和South Carolina 大学,2000年开始任职于Vanderbilt 大学,是该校流行病学系和流行病学中心的创始人。

郑教授主导了超过20 项大型人群流行病学研究,获得12 项以上美国RO1 等基金资助,研究对象20 余万人,其中包括“上海女性队列研究”;发表文章600余篇,包括J Clin Oncol、J Natl Cancer Inst、Nat Genet、Lancet Oncol、N Engl J Med、JAMA 等医学顶尖杂志的文章,主要涉及肿瘤、糖尿病等慢性疾病。郑教授是“亚洲队列研究协作组”的执行委员,并主导多项肿瘤流行病学国际合作项目;他是美国NIH“杰出学者”(Merit Award)获得者,是全美肿瘤流行病学界获得此荣誉的2 名学者之一。郑教授还是NIH 等基金的固定评审专家,并担任多种流行病学和肿瘤学杂志的编委。

生物通推荐原文摘要:

Large-scale genetic study in East Asians identifies six new loci associated with colorectal cancer risk

Known genetic loci explain only a small proportion of the familial relative risk of colorectal cancer (CRC). We conducted a genome-wide association study of CRC in East Asians with 14,963 cases and 31,945 controls and identified 6 new loci associated with CRC risk (P = 3.42 × 10−8 to 9.22 × 10−21) at 10q22.3, 10q25.2, 11q12.2, 12p13.31, 17p13.3 and 19q13.2. Two of these loci map to genes (TCF7L2 and TGFB1) with established roles in colorectal tumorigenesis. Four other loci are located in or near genes involved in transcriptional regulation (ZMIZ1), genome maintenance (FEN1), fatty acid metabolism (FADS1 and FADS2), cancer cell motility and metastasis (CD9), and cell growth and differentiation (NXN). We also found suggestive evidence for three additional loci associated with CRC risk near genome-wide significance at 8q24.11, 10q21.1 and 10q24.2. Furthermore, we replicated 22 previously reported CRC-associated loci. Our study provides insights into the genetic basis of CRC and suggests the involvement of new biological pathways.


 

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