国际联盟宣布大西洋鲑鱼测序完成

【字体: 时间:2014年06月12日 来源:生物通

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  一个国际联盟今天宣布,他们已经对大西洋鲑鱼(Atlantic salmon)的基因组进行了测序。研究人员表示,鲑鱼的参考基因组将有助于水产养殖,保护野生种群,并助力相关物种(如太平洋鲑鱼和虹鳟鱼)的研究。

  

生物通报道 一个国际联盟今天宣布,他们已经对大西洋鲑鱼(Atlantic salmon)的基因组进行了测序。研究人员表示,鲑鱼的参考基因组将有助于水产养殖,保护野生种群,并助力相关物种(如太平洋鲑鱼和虹鳟鱼)的研究。

大西洋鲑鱼基因组测序的国际合作组织(International Cooperation to Sequence the Atlantic Salmon Genome)的负责人Steinar Bergseth表示:“全基因组的知识让我们能够看到基因如何相互作用,并了解控制一定性状(如疾病抗性)的确切基因。”

大西洋鲑鱼主要分布在北大西洋海域以及流入北大西洋的河流中。然而,在过去的几十年,由于过度捕捞和栖息地变化等因素,野生大西洋鲑鱼的数量显著下降。为了满足市场需求,欧洲北部及北美洲的一些国家开始大量养殖大西洋鲑鱼。在加拿大,大西洋鲑鱼的养殖每年带来了超过6亿美元的收入。

ICSASG是一个由加拿大、智利和挪威的资助机构、产业界以及研究人员组成的合作组织。在本周于温哥华举行的鲑鱼综合生物学国际会议上,ICSASG介绍了大西洋鲑鱼的基因组。发言人表示,基于这些序列的文章正在撰写之中。

早在2010年,该联盟就在《Genome Biology》上宣布了这一测序计划。不过,它也指出,鲑鱼基因组测序面临多个挑战。特别是,这是个同源四倍体基因组,包含长且频繁的重复。不过,该联盟也表示,它会通过测序双单倍体(double-haploid)的雌鱼来克服一些挑战。这条雌鱼的昵称为莎莉(Sally)。

通过大西洋鲑鱼基因组的测序,研究人员和业界合作伙伴希望能够培育出更健康、生长更快的鱼类。

挪威鱼类养殖公司的养殖主管Petter Arnesen表示:“(鲑鱼的)序列将有助于开发更高效的选择性育种工具,这将让我们更好地选择出具有理想性状的亲鱼,用于鲑鱼的繁殖。”

“对遗传物质的了解加深让我们能够利用更多来自养殖鲑鱼的遗传变异。此外,这些序列为研究生物和生理过程开辟了新局面,”Arnesen补充道。

据ICSASG介绍,大西洋鲑鱼的基因组序列将在GenBank中提供。(生物通 薄荷)

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