中国科学家Nature Genetics发表癌症新文章

【字体: 时间:2014年07月08日 来源:生物通

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  来自上海交通大学、中国科学院、复旦大学等处的研究人员,针对胆囊癌(gallbladder carcinoma)开展全外显子组和靶向基因测序鉴别出了一些频发突变,并证实ErbB信号通路在胆囊癌的发病机制中起重要的作用。这些研究结果在线发表在7月6日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。

  

生物通报道 来自上海交通大学、中国科学院、复旦大学等处的研究人员,针对胆囊癌(gallbladder carcinoma)开展全外显子组和靶向基因测序鉴别出了一些频发突变,并证实ErbB信号通路在胆囊癌的发病机制中起重要的作用。这些研究结果在线发表在7月6日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。

上海交通大学的刘颖斌(Yingbin Liu)教授、中科院的王慧(Hui Wang)研究员,以及复旦大学的Yun Liu是这篇论文的共同通讯作者。刘颖斌教授主要从事肝胆胰胃等恶性肿瘤的临床和基础研究,擅长肝胆胰胃等恶性肿瘤及疑难病例的诊断。王慧研究员的主要研究方向包括肿瘤分子靶点和营养药学的应用基础研究;营养和食品安全的基础和应用研究。

胆囊癌是消化道常见的恶性肿瘤之一,占消化道癌肿的8.5%,居第五或第六位,且其发病率呈逐年增高趋势。引起其发病的风险因子包括胆结石、慢性炎症以及胰胆管合流异常等。由于胆囊癌无特异性的临床表现,胆囊癌患者早期常无特殊症状,因此临床发现的胆囊癌多属中晚期且进展迅速,误诊率高,手术根治性切除率低,预后差。胆囊癌患者的平均存活期不到1年。胆囊癌细胞往往具有高转移性,目前对于这一疾病的发病机制仍知之甚少。

在这篇新文章中,研究人员报告称通过外显子组测序和对癌症相关基因进行超深度测序(延伸阅读:NEJM发布基因组和外显子组测序的临床指南),他们在57对肿瘤及相匹配的正常样本中鉴别出了一些体细胞突变。确定了一些基因发生了频繁的非沉默突变(non-silent mutation),其中包括TP53 (47.1%), KRAS (7.8%) 和ERBB3 (11.8%)。并且,研究人员发现ErbB信号通路(包括EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4和它们下游的基因)是胆囊癌中最广泛突变的信号通路,36.8% (21/57)的胆囊癌样本受此影响。进一步的多元分析显示,ErbB信号通路突变的病例预后较差。

这些研究结果提供了胆囊癌体细胞突变景观一些新见解,证实了ErbB信号通路在胆囊癌发病中的关键作用。这为更深入地了解胆囊癌的发生发展机制以及开发出新型靶向性疗法提供了重要的分子基础。

(生物通:何嫱)

作者简介:

刘颖斌

男,汉族,中共党员,1964年3月出生;1997年9月至2000年7月在浙江大学医学院获博士学位;2000年7月至2008年7月在浙江大学医学院附属二院先后聘任为讲师、副教授、主任医师。现任上海交通大学附属新华医院普通外科行政主任、主任医师、硕士研究生导师、博士研究生导师、教授;同时兼任中国抗癌协会胰腺癌专业委员会委员、中国中西医结合学会围手术期专业委员会常务委员、中国实用外科杂志编委、实用肿瘤杂志常务编委、外科理论与实践编委、肝胆外科杂志青年编委、世界胃肠病学杂志编委、肝胆胰外科杂志特约编委、消化外科杂志特约编委、浙江临床医学杂志特约编委、中华医学杂志审稿专家、中华外科杂志审稿专家。 主要从事肝胆胰胃等恶性肿瘤的临床和基础研究。擅长肝胆胰胃等恶性肿瘤及疑难病例的诊治,手术技巧娴熟,在肝、胆、胰等恶性肿瘤的治疗和研究中取得了一定成绩,其中关于胃癌手术的外科治疗达到国际先进水准,曾受邀参加国际肝胆胰年会做胃癌专题报告,其关于胰腺癌的手术治疗录像在全国大赛中获得三等奖。熟练掌握了肝癌、胆囊癌的分子生物学研究技术与方法和策略,率领课题组在国际上首先建立了胆囊癌肝转移模型,其胆囊癌的研究在国内处于领先水平。

王慧

1999年在天津医科大学/美国伯明翰阿拉巴马大学(UAB)获得医学、理学博士学位(中美联合培养);1999年至2001年在美国UAB大学从事博士后研究;之后在美国UAB大学临床药理部、药理与毒理系任讲师(2001-2002)、助理教授及癌症药理学中心实验室副主任(2002-2005);2005年10月至今任中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所研究员、博士生导师、研究组长,食品安全研究中心主任(2007-)。现任卫生部食品安全审评专家,第一届食品安全国家标准审评委员会委员、微生物分委员会主任委员,国家食品和药品监督管理局新药审评专家。2006年入选上海市“浦江人才计划”,2007年入选中国科学院“****”。长期从事转化医学应用基础研究,任《Acta Pharmacologica Sinica》编委、《食品安全质量检测技术》编委等。
 
研究方向:
(1) 肿瘤分子靶点和营养药学的应用基础研究:发现肿瘤人群易感标志物和诊断治疗新靶点,研究靶点功能及其分子调控和信号转导,探索以膳食营养素、天然植物活性成份、化学小分子探针等靶向干预和治疗肿瘤的新机制和新方法。(2)营养和食品安全的基础和应用研究:营养成分安全性评价及毒理学基础,食物中有毒有害物质代谢途径和致病机理,食品安全风险评估、预防控制和检测新技术研究。

生物通推荐原文摘要:

Whole-exome and targeted gene sequencing of gallbladder carcinoma identifies recurrent mutations in the ErbB pathway

Individuals with gallbladder carcinoma (GBC), the most aggressive malignancy of the biliary tract, have a poor prognosis. Here we report the identification of somatic mutations for GBC in 57 tumor-normal pairs through a combination of exome sequencing and ultra-deep sequencing of cancer-related genes. The mutation pattern is defined by a dominant prevalence of C>T mutations at TCN sites. Genes with a significant frequency (false discovery rate (FDR) < 0.05) of non-silent mutations include TP53 (47.1%), KRAS (7.8%) and ERBB3 (11.8%). Moreover, ErbB signaling (including EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4 and their downstream genes) is the most extensively mutated pathway, affecting 36.8% (21/57) of the GBC samples. Multivariate analyses further show that cases with ErbB pathway mutations have a worse outcome (P = 0.001). These findings provide insight into the somatic mutational landscape in GBC and highlight the key role of the ErbB signaling pathway in GBC pathogenesis.

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