付向东等全面解读T细胞可变剪切

　　

生物通报道：mRNA是DNA和蛋白质生产之间的桥梁。当mRNA将DNA的遗传信息带出细胞核时，需要去除非编码片段，将剩下的片段拼接在一起。通过这样的可变剪切，细胞可以生产出大量具有不同功能的蛋白。

宾夕法尼亚大学和加州大学的研究团队深入分析了T细胞的可变剪切及其调控机制，揭示了在人类免疫系统发育过程中改变基因表达的一系列事件。这项研究发表在近日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上，文章的通讯作者是宾夕法尼亚大学的Kristen Lynch教授，加州大学的著名华人学者付向东（Xiang-Dong Fu）教授也参与了这项研究。

“解析可变剪切的机制和模式，有助于全面理解细胞在不同条件下对基因组的解读，”Lynch说。可变剪切是基因调控的一个关键机制，能对T细胞的发育和抗原信号进行应答。不过人们还不清楚这种调控的具体规模和机制，尤其是在T细胞的发育过程中。（延伸阅读：Cell子刊：探寻新型免疫细胞的成熟机制）

T细胞在对抗感染或者发育成熟的时候，需要借助多种新蛋白才能做出必要的改变。细胞一般通过两种途径做到这一点：启动新基因生产新蛋白，或者改变mRNA剪切模式获得蛋白异构体。这两种机制既能独立起作用，也能共同起作用。

研究人员发现，T细胞在应答入侵抗原或者肿瘤时，RNA结合蛋白CELF2的表达水平会提高。在体外培养的T细胞中，CELF2增多使mRNA剪切发生了广泛的改变。在胸腺中，CELF2增多也和T细胞发育时的剪切变化有关。

研究人员通过二代测序列出了T细胞五千个外显子的剪切模式，分析了T细胞激活时发生的剪切改变。可变剪切会使蛋白质发生重要的生理改变，比如蛋白质活性、作用位点以及蛋白质互作。

“我们这是首次列出T细胞发育过程中的剪切改变，”Lynch说。“研究表明，在T细胞激活和T细胞发育过程中，CELF2表达水平提高引起了大量的剪切改变。这些结果为人们提供了宝贵的线索，有助于进一步理解T细胞的剪切调控，以及CELF2在其中起到的重要生物学作用。”

 

生物通编辑：叶予

生物通推荐原文：

Induced transcription and stability of CELF2 mRNA drives widespread alternative splicing during T-cell signaling. Proceedings of the National Academy of Sciences