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糖芯片分析实验指导
【字体: 大 中 小 】 时间:2015年04月09日 来源:生物通
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近年来一种用于分析遗传物质的新技术被证明适用于糖生物学,这就是芯片技术。第一个糖芯片诞生于2002年,也就是在芯片技术问世后,用于研究基因表达后的第7个年头。
经过多年的探索,科学家们已经掌握了不少糖体分子的基本生物学特征,但是比较于DNA和蛋白,我们对于这些分子的了解还远远不够,然而由于糖体结构复杂,要想构建出这种分子非常困难,而且与DNA不同,糖体几乎是不可能克隆和扩增的,因此数量也是有限。
近年来一种用于分析遗传物质的新技术被证明适用于糖生物学,这就是芯片技术。第一个糖芯片诞生于2002年,也就是在芯片技术问世后,用于研究基因表达后的第7个年头。
糖芯片由少量多种类的天然或合成的低聚糖组成,研究人员利用这种芯片能识别结合在糖上的蛋白,细胞和微生物。由于芯片制作只需要极少量的糖分子,因此这种技术得以首次能进行蛋白糖亲和性的广泛筛选。
目前有十几个实验室构建自己的糖芯片,随着更多的糖分子被分离和合成出来,这些芯片将会不断完善。目前制造生产最大及最多糖芯片的是一个国际性的研究协会:功能糖组学协会(Consortium for Functional Glycomics,CFG,生物通译),以及英国伦敦帝国学院的糖科学实验室,其它一些实验室则主要是针对自己的实验项目进行小规模的制作。
“在这一点上我认为没有什么单个平台的赢家”美国国家癌症研究所化学糖生物学组组长Jeffrey Gildersleeve说。
由于RNA测序价格下降,DNA芯片已不再像以前那样受到瞩目,但糖芯片的未来却被看好,“我认为未来五年里,(糖芯片)就会开始商业化,进入工业应用和临床应用领域,”埃默里大学医学院功能糖组学国家中心(NCFG,生物通译)主任Richard Cummings说。
糖芯片制备原理
糖芯片的制备原理与基因芯片,蛋白芯片相似,是将多种微量的糖类化合物以点阵的形式固定在某种材料制作的底片上,采用高通量扫描技术和荧光染色等手段分析和检测糖分子与其它生物大分子之间的特异性结合,进而研究其生物功能和作用机制。
糖芯片具有检测样品用量少,特异性高,高敏感性,高通量和长期稳定性等优点,极大的提高了糖化学研究的效率,这种芯片可以分成单糖或二糖芯片,寡糖芯片,多糖芯片和复合式芯片,另外根据用途不同也可以分成功能糖组学芯片,药物开发糖体芯片和糖抗原免疫诊断芯片等。
制备糖芯片的方法有非化学修饰糖类固定和化学修饰糖类固定,前者通过点样仪点样将糖直接固定在玻片上,属于非特异性结合,这种方法无需对糖基进行修饰。但是由于糖类化合物的性质,如分子量,空间结构,溶解性,反应位点等都不同,因此有些糖类化合物无法直接以非共价结合的方式直接固定在固体介质上,为此科学家们就需要对糖进行化学修饰,即嫁接上能与载体表明产生特异性结合的基团,然后再固定。