“光滑双脐螺基因组计划”完美落幕

　　

《Nature Communications》杂志发表了吸血虫的主要中间宿主之一“光滑双脐螺”的全基因组序列分析结果：混合桑格测序法、454测序法和Illumina双末端测序法，自动预测生成了14423个基因模型，通过Illumina PE读取，研究人员映射12个不同部位的螺组织转录组来辅助基因注释。参考预测蛋白质组和分泌组的新陈代谢途径，使用KEGG10分析了包括单核苷酸变异（SNV）在内的多态性打分结果。结合基因表达的器官特异性，这项研究提供了螺类应对自然突变和寄生虫侵染时的潜在分子标记，也包括吸血虫易感机制和耐药表型的分子标记。

生物通报道：在非洲，如果你把手放入尼罗河内，即可感染一种寄生虫病，让你腹部变大。

隋•巢元方等《诸病源候论•水蛊候》云：“此由水毒气结聚于内，令腹渐大”。

中国古代文献称“蛊”或“水蛊”，现代名叫 吸血虫（schistosomiasis），又名裂体吸虫。湖北江陵西汉古尸体内曾检获吸血虫卵。幼虫寄宿在螺类动物体内，成熟后通过口或皮肤进入包括人在内的脊椎动物内，寄生在肠系膜或膀胱，虫卵随粪便或尿液排出。感染后，初期发热怕冷，咳嗽，胸痛，日久天长便会腹水肿胀。全球保守估计5-6亿人口受吸血虫病威胁，每年有上千万人感染后不治身亡。

相关研究学者评价：除疟疾以外，吸血虫病是地球上影响最恶劣的寄生虫疾病。

了解中间宿主螺的基因组及其与吸血虫和终末端宿主基因组之间的关系，对于寻找有效的分子手段防治吸血虫病意义重大。人类的基因组和吸血虫基因组测序完成之后，螺的基因组测序开始进入人们的视野。自2001年光滑双脐螺基因组计划启动以来，多家机构参与了庞大的（18条染色体，总碱基数约916Mb）光滑双脐螺基因组的测序工作。

2017年5月16日，《Nature Communications》杂志终于发表了吸血虫的主要中间宿主之一“光滑双脐螺”的全基因组序列分析结果，该项目由新墨西哥大学领导，总计100多名科学家为之付出了努力。

“测序、构建遗传物理图谱、和注释光滑双脐螺基因组让我们知道了许多有用信息，”本项研究的领军人物之一，新墨西哥大学进化和理论免疫学中心的Coen Adema（图中右三）说。“这些信息不仅可以帮助我们了解动物的进化，同时还可以帮助相关工作者们最小化全球性的寄生虫感染。”

Adema认为，如果科研人员可以切断寄生虫在螺内的寄生周期，寄生虫就不能完全成熟，自然也就不能感染终端宿主。目前，我们已经发现了许多能限制寄生虫生命周期的相关途径。其中的某一条很可能引领我们消灭吸血虫或吸血虫病。

关于文中提到的这些新基因的发现，仍需基因功能方面的探索和基因差异表达分析，运用基因组所提供的信息，使用不同的方法与疾病和致病寄生虫抗争。光滑双脐螺还是一个很好的寄生虫感染模式生物，它将有助于基因表达调控、比较免疫、胚胎学、螺类基础科学、动物进化学等相关领域的研究。

原文标题：Whole genome analysis of a schistosomiasis-transmitting freshwater snail