怎样在5分钟内把我的SCI待投文章增加1~2分？

　　

又快到年底国自然申请季了，广大科研工作者朋友们又开始着急发文章给自己的标书“前期工作基础”增加筹码了。其实很多朋友的文章都可以在几分钟内有机会增加1~2分（主要是肿瘤方向的），今天Dr.S就告诉大家该怎么做。

一个朋友的文章非常的典型，他在两株肿瘤细胞中验证了一个基因的功能，做了裸鼠成瘤实验，也用WB和qPCR验证了目的基因下游的机制基因。文章结构已经出来了，Dr.S觉得欠缺了两点：

1. 没有临床相关性（分期分级以及预后数据）
2. 缺少一张酷炫的机制分析图

有了这两点的增益，文章可以往更高1~2分的杂志去投。但是朋友就提问了：我没有临床样本，我也不会生信分析怎么办啦？

Dr.S的干货来啦：

首先介绍一下如何用TCGA数据库分析基因的临床相关性

1. UALCAN数据库 http://ualcan.path.uab.edu/index.html

这个是Dr.S最常用的一个数据库，它可以分析一个基因在TCGA数据库样本中和癌和癌旁、分期分级、预后等因素是否相关。

我们点右上角的analysis，进入以下页面：

在文本框中填写基因名字，可以填好几个哦，选择好癌种，然后按Explore

点击Expression可以看这个基因在癌和癌旁以及不同病理分级，年龄，性别，体重，种族等的相关性。还可以看p值。

点击survival可以看到这个基因在特定癌种里的预后生存情况。

点击correlation可以看所有和这个基因表达量正相关或者负相关的基因，可以帮助确定到底选哪个基因当做机制研究基因。

2. PROGgene数据库 http://watson.compbio.iupui.edu/chirayu/proggene/database/?url=proggene

如果很可惜TCGA数据库里这个基因的临床相关性不是很好的话，没关系，Dr.S还有一个小帮手经常可以反败为胜。PROGene数据库是可以分析多个GEO数据包中基因的预后的神器。

可以看单个基因也可以看几个基因的预后。选择有预后相关性的数据导出放到文章里就行啦。

专治TCGA没预后的基因（捂脸笑）

3. Kmplot数据库 http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background

还有一个神器，甚至可以看miRNA的预后，而且是把大量的GEO数据包合在一起形成上千例样本的预后相关性。操作很简单，我就不详细介绍浪费篇幅了。

当然，如果因为网络问题有几个神器数据库可以替代使用

OncoLnc数据库http://www.oncolnc.org/
Proteinatlas数据库http://www.proteinatlas.org/
Starbase数据库http://starbase.sysu.edu.cn/
Genemini数据库http://gemini.cancer-pku.cn/

OK，如果你已经在文章里加了几幅临床相关性（癌和癌旁，分期分级，TCGA预后，GEO预后）的图以后，文章已经变得很好看了，但是，想知道怎样榨干你的WB和qPCR最后一点利用价值吗。再介绍你一个神器：genemania 数据库http://genemania.org/

在文本框里填写目的基因和WB、qPCR验证的阳性机制基因，然后点击绘图

系统就会帮你查文献，然后绘制出一张酷炫的PPI图，可以选择各种物理互作、共表达等相关基因形成网络，如果你觉得样子太丑还可以自己调整网络的样子。

有了这些额外添加的有意义的数据，5分钟里就能把文章档次增加个1~2分！

好了，今天先聊到这里，Dr.S电脑里还有很多各种各样的数据库可以帮助到做医学和生物研究的你哦，如果这篇文章的阅读量超过5000的话，Dr.S会开启一个新的神器分享系列！大家也可以在留言区留言说出你想要哪方面的数据库介绍，期待你的留言和转发哦！

想发国自然高分文章的可以来咨询我们哦