天然HIV-1核心的结构及其与IP6和CypA的相互作用

天然HIV-1核心的结构及其与IP6和CypA的相互作用

　　

摘要

病毒衣壳在HIV复制中起着重要作用，是宿主因子参与的主要平台。为了克服研究天然衣壳结构的挑战，我们使用产气荚膜溶解酶O来刺穿HIV-1颗粒的膜，从而允许宿主蛋白质和小分子进入天然衣壳，同时提高低温电子显微镜图像质量。利用低温电子断层扫描和亚组分平均技术，我们测定了在存在和不存在六磷酸肌醇（IP6）和亲环素A的情况下，天然帽状体的结构，并构建了一个完整的HIV-1衣壳的全原子模型。我们的结构揭示了两个IP6结合位点和亲环素A相互作用的模式。自由能计算证实了R18和K25的两个结合位点，并进一步显示了IP6通过五聚体的一个禁止性的能垒。我们的研究结果表明，产气荚膜溶解素O穿孔是一个有价值的工具，它可以用来分析病毒外壳的结构和与宿主细胞因子的相互作用。