全动物复合单细胞RNA-seq显示水母Clytia细胞类型的转录转移

全动物复合单细胞RNA-seq显示水母Clytia细胞类型的转录转移

　　

摘要

我们提出了一个有机体范围内，水螅水母转录组细胞图谱半球夜蛾并描述其组成细胞类型如何响应扰动。利用多重单细胞RNA测序，将单个动物从控制条件和扰动条件下进行索引和汇集到一个单独的测序过程中，我们避免了批量效应产生的伪影，并且能够识别出细胞状态对组织扰动的响应变化。这项工作为将来研究一种可遗传驯化水母的发育、功能和再生奠定了基础。此外，我们还为高分辨率、全动物、多功能的单细胞基因组学引入了一个强大的工作流程，可以很容易地适应其他传统或非传统模式生物。