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g-TUBE管子+离心机 = 6-20 kb DNA,轻松助力长读长测序!

【字体: 时间:2021年03月01日 来源:基因有限公司

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  三代单分子测序,mate-pair测序等长读长测序,往往需要长片段基因组DNA,基因有限公司代理的Covaris g-TUBE仅需搭配离心机使用,轻松实现6-20 kb的长片段DNA打断,是三代测序Pacbio等推荐的长片段DNA打断耗材。

三代单分子测序,mate-pair测序等长读长测序,往往需要长片段基因组DNA,基因有限公司代理的Covaris g-TUBE仅需搭配离心机使用,轻松实现6-20 kb的长片段DNA打断,是三代测序Pacbio等推荐的长片段DNA打断耗材。

突破性的DNA剪切技术!

g-TUBE的原理是利用离心力推动样品通过精确制造的孔口,对样本产生剪切力,从而使DNA片段化。通过调整离心机转子转速和时间,改变通过孔口的流量,从而改变剪切力,达到控制剪切片段大小的目的,较高的离心转速将产生较短的DNA片段,参照Protocol设置离心转速和时间,即可剪切得到目的片段。

g-TUBE整个操作过程见下,加入样品,离心再倒转离心一次,完成!就是这么简单易用!

剪切过程

剪切性能优

图1. 使用g-TUBE搭配离心机对基因组样本进行剪切,以获得6kb、8kb、10kb、20kb的DNA片段。剪切结果经0.5%琼脂糖凝胶以及Agilent 2100检测,结果显示g-TUBE可对DNA进行高质量的剪切,DNA片段紧密分布在指定大小范围内。

重复性高

图2. 18个相同DNA样品,均用g-TUBE在8000 rpm 处理 60s,琼脂糖跑胶结果显示均剪切至10kb左右,表现出良好的重复性。

测序对比

图3. 分别用Covaris g-TUBE 和 Hydroshear DNA片段化仪对同一E Coli 基因组DNA 超声打断至10kb,进行2个不同input DNA 量(7.5μg和15μg)的重复。文库构建按照Libraries PacBio RS protocols ,并用PacBio RS 测序。测序结果对比如下,用Covaris g-TUBE打断的基因组样本构建的文库测序无论是从文库产出还是测序覆盖度等方面均远优于Hydroshear 组。

Tips:除了6-20kb长片段剪切,作为核酸剪切金标准的Covaris 提供从100bp-5kb的全套核酸解决方案,并配备高通量片段化核酸到文库构建一体化方案,满足您的不同需求。

基因有限公司作为Covaris公司中国代理商,为您提供DNA 片段化、ChIP实验、FFPE样本核酸提取、蛋白提取解决方案等。基因有限公司的宗旨是“专才为专家服务”,有专业团队为各大科研机构提供安装培训,技术支持,应用培训与售后维护一条龙服务,赢得客户的一致好评与信任。

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