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遗传学家通过古代DNA发现了新的野生山羊亚种
【字体: 大 中 小 】 时间:2022年10月09日 来源:eLife
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来自都柏林三一学院的遗传学家与一个国际合作团队一起,发现了一个以前不为人知的超过一万年历史的野生山羊谱系。这种新的山羊是通过对骨骼遗骸的基因筛选发现的,被称为“牛角羊”,很可能在最后一次冰河盛期(冰河时代)幸存下来,它们的祖先被困在土耳其金牛座山脉的高峰上,在那里发现了它们的遗骸。
来自都柏林三一学院的遗传学家与一个国际合作团队一起,发现了一个以前不为人知的超过一万年历史的野生山羊谱系。这项研究经过PCI基因组学的公开同行评审和推荐,并刚刚发表在《eLife》杂志上。这种新的山羊是通过对骨骼遗骸的基因筛选发现的,被称为“牛角羊(the Taurasian tur)”,很可能在最后一次冰河盛期(冰河时代)幸存下来,它们的祖先被困在土耳其金牛座山脉的高峰上,在那里发现了它们的遗骸。
Direkli洞穴的一个偶然发现
12000多年前,土耳其南部金牛座山脉的狩猎者和采采者严重依赖当地的猎物来获取食物和生存。Direkli洞穴海拔约1100米,大约3000年(约14000-11000年前)以来,它一直是这些猎人的季节性营地,可能全年都有人居住。
“在Direkli洞穴发现的文物中,有大量带有明显加工痕迹的骨头残骸,这表明野生山羊曾在那里被屠宰食用,”来自三一学院遗传学和微生物学学院的Kevin Daly博士说,他是这篇研究文章的第一作者。“由于洞穴被高达2200米的山峰包围,今天居住在该地区的野生山羊或牛黄山羊(Capra aegagrus)很可能是这些晚更新世猎人的目标。”
在对来自Direkli的山羊骨遗骸进行基因筛选时,遗传学家们注意到一些不寻常的事情:许多山羊携带着与另一种野生山羊相似的线粒体基因组。
虽然家山羊是由牛黄山羊进化而来的,但其他种类的野生山羊今天仍然存活,而且只在相对有限的地区发现。其中包括东高加索山羊和西高加索山羊,这是野生山羊的两个姐妹种(或亚种),现在只在格鲁吉亚的高加索山脉发现。尽管Direkli洞穴距离它们目前的栖息地约800公里,但许多Direkli洞穴样本都携带着与这些高加索turr相关的线粒体。
Daly博士补充说:“更令人惊讶的是,当我们检查Direkli洞穴山羊的核基因组时:虽然大多数看起来像牛黄羊,但正如我们所料,有一个样本似乎与其他样本不同。这个样本,Direkli4,比其他Direkli山羊显示了更多的祖先遗传变异,表明它可能是一个不同的物种。”
为了更好地理解这一点,三一学院的团队与来自Muséum national d’histoire naturelle of Paris的研究人员合作,从Capra 类群的其他物种中提取基因数据。
一个新的Tur血统
研究小组惊讶地发现,Direkli4样本实际上似乎是东方和西方类型的姐妹组。在好奇心的驱使下,研究小组从Direkli洞穴中筛选了更多的材料,并发现了另外两个具有“类Tur”基因组的样本,这表明,这些Tur家族的一群人生活在金牛山,与当地的牛黄羊很近,在史前时期都被人类猎杀。
研究小组建议为发现的牛角羊取一个名字:Capra taurensis或Capra caucasica taurensis。
由于山羊tur比其他野生山羊更大更重,有独特的角形状,应该有可能在动物遗骸中确定一组山羊的亲属。
气候变化和人类活动的受害者?
研究小组认为,在过去的10万年里,Tur的祖先生活在更广阔的地理区域,从高加索山脉到地中海边的金牛座山脉,气候变化可能导致了栖息地的分裂。
Daly博士说:“末次冰期或冰河时代可能使许多地区变得不适合居住,迫使这些山羊与其他物种竞争。”牛角羊群可能是一个遗留下来的族群,局限于金牛座山脉的山峰。不断增加的人类活动可能会给牛角羊带来额外的压力,狩猎在Direkli洞穴就证明了这一点。
“虽然我们不知道这个山羊谱系是何时或如何灭绝的,但在该地区进行的额外基因组调查可能表明,它们的基因组在当今的野生山羊中仍然存在。”
eLife